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故事设置在1994年，是全新篇章重启三部曲的开端，在剧情上衔接了真人电影《大黄蜂》的剧情。
讲述了地球上的战争不再只有汽车人和霸天虎，巨无霸、原始兽和龙头部队等更多角色也将加入其中，展现更多维的变形金刚真人宇宙，并将超能勇士、霹雳派和龙头部队引入到汽车人和霸天虎之间的地球大战中。
汽车人与霸天虎在几个世纪以前，就已经处于战争中。他们的后代巨无霸和原始兽，则将新一轮的战斗推向了史前时代。在寻找新能源的途中，霸王龙指挥原始兽通过时空跳跃来到史前地球，而巨无霸也跟着擎天圣来到了地球。
此后，霸王龙发现了汽车人留在地球的战舰方舟号，为了改变霸天虎战败的事实，霸王龙试图摧毁处在沉睡中的擎天柱，引发新一轮的战争
