妖妖梦共有三个可使用角色，每个角色有两种不同的符卡配置。博丽灵梦判定点较小，在穿越高密度的弹幕时相对轻松，但是她的火力相对较弱。雾雨魔理沙拥有着高移动速度和高威力的火力，不过攻击范围非常窄。十六夜咲夜的攻击比较多变，但是比较难以操作。
妖妖梦有着特色的得分系统——“樱点”系统。射击敌人和回收樱道具时，樱点会增加；不过高速射击比低速射击获得樱点的速度快很多。使用炸弹、中弹时樱点会大幅度减少。每获得50000点樱点时，（且自机不处于无敌状态时）会展开“森罗结界”；结界中，自机可以免疫中弹一次，且自动回收屏幕上的所有道具，擦弹可以使当前樱点数和樱点上限增加。结界时间到时，奖励当前樱点×10的分数并短时间无敌；在结界中，如果中弹或者主动使用炸弹会使结界破裂，没有樱点损失，全屏子弹转化为樱道具自动回收，但是这样做会使Spell Card Bonus归零。
在妖妖梦中低速时，会显示判定点，易于使得玩家擦弹。
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