这是人类首次发现超古代巨人，这也是复苏后的迪迦奥特曼的首战。面对两头超古代怪兽的围攻，迪迦又该如何战斗？21世纪初期的一个夜晚，一颗天外陨石打破了地球的宁静，再一次让地球陷入了动乱之中。而迪迦的故事也就此展开，好像是出现征兆一般。这颗陨石唤醒了沉睡在地球千年的怪兽，超古代怪兽哥尔赞和梅尔巴相继苏醒。
与此同时，胜利队的队员们针对于陨石里的时光机器也了解到了一些即将发生的事情。机器中出现的神秘女子名为幽怜，她告知她的后代们地球正在发生一些异变之灾，也说出了可以与之对抗的力量，即封印在金字塔中的光之巨人。但幽怜还未来得及说出解封的方法就消失了。
队员们经过一番讨论过后，结合如今的异变便马上展开了寻找金字塔的行动。飞机落地后，大家分头行动，几经寻找，众人终于看到了金字塔。此时的大古听到了神秘声音的召唤，尽管身后的丽娜3人大声呼唤，大古仍是发了疯一般地朝金字塔跑去。但尽管找到了巨人，大家对于如何让巨人复苏一点头绪都没有。
此时另一边的两头怪兽如约好一般也到达了金字塔附近。哥尔赞首先用超音波光线破坏了金字塔的外壳，随即和美尔巴一起开始破坏超古代巨人的石像。大古虽然尽力阻止了，但面对怪兽强大的力量，战机还是被不幸击中。就在千钧一发之际，大古化身一道光进入了仅存的迪迦石像体内，奇迹发生了。石像借助大古的生命完成了复苏，光之巨人迪迦正式登场。
在一番打斗过后，迪迦面对两头怪兽还是稍显落后，随即切换强力形态，单手挡住怪兽的光线，一个强力暴摔打的哥尔赞毫无还手之力。美尔巴见状，开启空中扫射模式进行掩护，哥尔赞则趁机开溜。眼见就剩下梅尔巴，迪迦转换为空中形态，使出一招帅气的飞踢击落美尔巴，最后以一招兰帕尔特光弹结束战斗。
战斗结束后，大古也出现在队员们的目光下，几人欢快地打坐一团，随即开始返航。返航途中，大古也意识到了自己或许获得了一种非常强的力量，但身上也担上了一份守护地球的重要责任。迪迦的故事也在此刻正式开始。
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