《最后的阴阳师》结局是男主重振旗鼓，再次踏上阴阳师之路，最终成功除鬼，保卫了平安京。
女主真姬在和男主经历种种事情之后，感情逐渐加深，但因身份特殊，一直孤独而行，最终男主理解并接受了她的身份，两人阴阳相隔，相约来世再见。此外，其他主要角色也都得到了圆满的结局。
《最后的阴阳师》大结局是男主实现了复仇，女主在男主的感化下放弃了报复，最终两人在一起了。最后他们带着收养的孩子离开东京过着新的生活。然而代价也是沉重的，一部分新都市町人未能脱离贫苦的生活。他成了消灭封建幽灵的死神，却也是维护社会的阴阳师。这段信息主要描述的是整个故事的结局以及男女主最终的结果。
