小智一行好不容易走出了常磐森林，终于来到了尼比市。
小智在神奇宝贝医疗中心发现了神奇宝贝联盟地区大会的宣传海报，他想要参加，但首先得打败好几位城镇道馆训练家，拿到认证徽章才行。
小智信心满满！去找尼比市道馆训练家小刚挑战，可惜失败了……
在神秘大叔的帮助下，皮卡丘进行了一次特训，加强它的电压，准备继续挑战。
第二次挑战开始，皮卡丘用电击误打误撞使道馆里水管破裂，岩石系的大岩蛇最怕水，而水能导电……
小智最终拿到了第一枚“岩石徽章”
道馆训练家小刚想做一名“神奇宝贝饲育家”，他很想加入小智，可他还要照顾弟弟妹妹们
不过没想到，神秘的大叔就是小刚离家多年的爸爸，为了让小刚能够追寻自己的梦想，他决定留下来代替小刚。
队伍又壮大了！
