主要是对呼吸系统的危害，尤其是肺。灰尘对人体的呼吸道有严重的影响，污染空气，有身体有害，主要是对肺部和呼吸道的破坏，造成环境的污染，使空气质量降低，影响人类生活质量。
正常情况下，鼻腔，鼻粘膜，支气管纤毛，对气体中的直径大的粉尘颗粒有一定的过滤作用。
灰尘对于人体的各个器官十分有害，特别是附带着金属离子、苯、甲醛等污染物的装修产生的颗粒物，通过鼻腔、上呼吸道等器官，会破坏人体的黏膜组织，导致头疼头晕、视力下降、呼吸困难、神经膜障碍等一系列疾病，严重时有生命危险。
据专家介绍，包括“非典”在内的病菌，一旦吸附在空气中的粉尘上，传播的可能就会大大增加。特别是直径小于2.5微米的细小灰尘，可以直接进入人体肺泡，把细菌带入体内。
经常在灰尘较多的环境下工作的人，因吸入的灰尘比别人多，因此，患矽肺病（肺病的一种）的几率也高，平常可多吃些猪血，因为这种东西是打灰的，可以帮助排除体内的灰尘。
灰尘的成份包括：漂浮状尘埃、尘虫及排泄物、纤维、病菌、化学烟雾等，它们常期漂浮在室内空气中并被大量吸入或附干物表面，不仅对人员健康产生危害，而且削减室内电子设备和精美装修的使用寿命。 环境监测结果表明：空气污染指数取决于飘尘多少。飘尘学名叫“可吸入颗粒物”，指直径小于10微米(1微米等于千分之一毫米)的灰尘。这些飘尘也渗入我们工作、休憩和生活的室内空间，最可怕的是直径小于2 5微米的微尘，它能透过人的肺泡、毛细血管壁进入血液，而且表面上经常聚集着各种有毒的物质和重金元素，不少物质能致癌。
对健康特别是有过敏性疾病有重大影响的是生物性颗粒物，其中包括尘螨，动物皮毛尘、真菌等。这些生物主要存活于灰尘中，其中1克灰尘甚至可附着800只螨虫。
