468集-469集
剧情大纲：水门及时救下了玖辛奈，在安置好鸣人和玖辛奈之后便前去迎战九尾，在用时空结界成功转移九尾的尾兽玉后，“面具男”突然从背后偷袭，水门用飞雷神之术脱身。随后二人展开对决。水门怀疑“面具男”可能是当年与初代火影交战过的宇智波斑，而且是个极其危险的人物，必须阻止他。
在经过两个回合的交手后，水门分析出对手忍术的弱点并制定出克敌之策，使用飞雷神二段并以螺旋丸重创“面具男”，并在“面具男”身上留下了飞雷神术式。随后水门使用契约封印解除了“面具男”对九尾的控制，“面具男”受伤逃走。
此时九尾仍然袭击木叶，水门以飞雷神之术将自己和九尾带离木叶村，同时将玖辛奈和鸣人带至现场。水门认为“面具男”将来一定会给忍界带来腥风血雨，最终水门做出了自己的选择：
为了夫妇二人可以在鸣人长大之后与其见上一面，为了能让爱人不留遗憾，也为了木叶村、火之国，乃至忍界的和平与安定，毅然决定牺牲自己的生命，由自己来封印九尾，并将九尾的一半查克拉以及自己和玖辛奈最后的查克拉一并封印在鸣人身上...
468集-469集
水门使用禁术尸鬼封禁将九尾的一半封印在了自己体内，之后又使用八卦封印将另一半封印在了刚出生的鸣人体内。
