第七季分为三个独立的故事，前三分之一可看作《星球大战：异等小队》的序幕，异等小队首次出场和阿纳金、雷克斯联手执行任务，营救克隆人战士“回声”；中间三分之一是阿索卡离开绝地武士团之后的冒险经历，阿索卡·塔诺在科洛桑第1313层遇到同样喜欢冒险的特蕾斯·马特斯（Trace Martez）和拉法·马特斯（Rafa Martez）姐妹；最后三分之一的故事无缝链接《星球大战前传3：西斯的复仇》，阿索卡在博-卡坦·克里兹要求下，率领克隆人501军团参加曼达洛围攻战，对抗摩尔，虽然阿索卡取得围攻战胜利，但66号指令却悄然而至，一切都将颠覆
结局克隆人获得了外星人赠与的心开始有了自己的意识，发现自己一直以来被人类利用抛弃便开启了复仇，和人类开始了最终决战。
