秦琼病逝于第33集，
这一集名为《别离》，讲述了秦琼生前的最后一次别离。在这一集中，秦琼已经病危，他躺在床上，面容憔悴。他的妻子和儿子都在他的身边，眼泪汪汪地看着他。秦琼的妻子林氏在他身边悄声哭泣，秦琼却仍然保持着镇静，安慰着家人。 在这个场景中，秦琼告诉儿子秦叔宝，他要离开这个世界了，他要去天堂寻找他的父亲。秦叔宝听了父亲的话，哭泣着说：“父亲，我不想你离开我啊！”秦琼安慰儿子说：“儿子，我一直都在你的身边，我永远不会离开你。” 最后，秦琼合上了眼睛，离开了人世。他的离世让唐朝失去了一位伟大的将领和文学家，也让观众感受到了历史的无情和生命的脆弱。他的英勇事迹将永远铭刻在历史的长河中，成为后人学习的典范。
隋唐英雄3秦琼是李世民被困越虎城那集死的。
