红衣男一跤摔出个狗屎运，眼前硕大的金子在向自己招手，原来这是要发大财。于是他拼命的挖了一天一夜，可金子大的他根本搬不动。这时女儿劝说红衣男再过两三个小时神秘岛就要完全沉没，红衣男挣扎片刻也不再留恋，立刻出发与肖恩父子会合。
另一边强森也很快到达悬崖边，可他们并没有看见潜艇，原来潜艇由于涨水早已被淹没。两人制作简易氧气瓶潜入海中，穿过一群水母终于看到了鹦鹉螺号，两人兴奋地往潜艇游去。他们拼力打开生锈的舱盖，不料一条电鳗向他们袭击过来。两人很快钻入潜艇，小恩拉开水闸，潜艇水瞬间被排干。
此时整个神秘岛已经山崩地裂，他们试图启动按钮，奈何潜艇经过百年电量早已耗尽。强森打开引擎盖，若要启动潜艇需要数千瓦的电量。此时两人望着窗外的电鳗，强森有个大胆的计划，他让肖恩引诱电鳗靠近潜艇，自己则用长鱼叉连接到潜艇的电池上。在电鳗冲来的一瞬间，他用力戳进电鳗体内，电鳗瞬间成为大型充电桩，潜艇立刻启动成功。
而另一边爷爷指南针事故导致几人迷失方向，只能靠蜘蛛织网寻找出路。几人经历艰险终于来到海边，可却没有看见潜艇，海面岩石开始震动崩裂，天空电闪雷鸣，他们所在的石头也被巨浪掀起，三人逃命跳入海中。幸好肖恩经过此地救了三人，但水中掉落大石头挡住了前方去路。
强森扛起潜艇里一颗炮弹，找准目标直接炸出一条通道，巨石被击打粉碎，几人顺利逃出安全地带。影片到这里圆满结束，肖恩也顺利从神秘岛带回爷爷。
这是一部美国科幻电影，是继地心历险记后又一部3D动作冒险片，全程带你感受荒岛逃生的奇妙世界。
