魔法学院通常拥有各种不同的系，包括魔法学、咒术学、占卜学、魔药学、魔法工艺学、变形学和黑魔法学等。
魔法学系主要研究基本的魔法理论和技巧，咒术学则专注于各种咒语和符咒的运用，占卜学则探索未来预测和卜卦术等技能。
魔药学是研究魔药和草药的应用，魔法工艺学则关注于制作魔法工具和装备的技术，变形学研究幻形术与形态转变，而黑魔法学则是探究禁忌和危险的黑魔法知识。这些系共同构成了魔法学院丰富的学科体系。
格雷魔法学校有16个系，包括炼金术、驯兽术、马语、魔杖制作和咒语。进入魔法学校的学生被分住在4座古代建筑里―风、水女神、侏儒和火蜥蜴。
