被SCI收录的微生物学会因影响因子不同有着不同的排名，前10名就是微生物top10期刊。以下是微生物学前10名SCI期刊的名单。
1、NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY(IF=88.1，TOP1)
发表微生物学领域的评论、观点和意见。
2、Lancet Microbe(IF=38.2，TOP2)
世界领先的微生物研究杂志。发布各种规模微生物的临床相关内容，从微生物的性质(例如，抗微生物药物抗性基因/质粒、毒力因子)到微生物组、病理学(包括免疫学)到群体水平的影响(例如，爆发、流行病学)。
3、CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS(IF=36.8，TOP3)
分析临床微生物学和免疫学的最新发展，提供该领域的最新知识，以及关于有争议问题的平衡的、发人深省的观点。
4、Cell Host & Microbe(IF=30.3，TOP4)
为研究微生物的科学家与研究宿主免疫、细胞生物学和微生物定殖或感染后的分子反应的科学家之间提供一个交流思想和概念的论坛。
5、Nature Microbiology(IF=22.9，TOP5)
对微生物的所有方面都感兴趣，无论是它们的进化、生理学还是细胞生物学;它们彼此之间、与宿主或与环境之间的相互作用;或者它们的社会意义。
6、TRENDS IN MICROBIOLOGY(IF=15.9，TOP6)
为讨论微生物学的各个方面提供了一个多学科论坛：从细胞生物学和免疫学到遗传学和进化，涵盖病毒学、细菌学、原动物学和真菌学。
7、Microbiome(IF=15.5，TOP7)
考虑发表广泛涉及微生物群落研究的主题。
8、CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION(IF=14.2，TOP8)
欧洲临床微生物学和传染病学会的英文月刊，发表同行评审论文，介绍与微生物学、传染病、病毒学、寄生虫学、免疫学和流行病学领域的治疗和诊断相关的基础和应用研究。
9、Emerging Microbes & Infections(IF=13.2，TOP9)
发表与新出现的传染病有关的各种科学报告，特别是来自发展中国家的新信息，以及新出现的微生物(细菌、病毒、真菌和其他病原体)的发现。
10、MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS(IF=12.9，TOP10)
使研究人员了解微生物学以及免疫学、分子和细胞生物学等相关领域的最新发展。
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