幻之宝可梦
通常，幻之宝可梦无法在一般游戏过程中获得，而是在特定时间或地区的活动中，由神秘礼物直接领取或其发送的道具触发特殊事件才能与之相遇。因此，幻之宝可梦不算在集齐宝可梦图鉴所需要的宝可梦中。目前为止，仅《欧米伽红宝石／阿尔法蓝宝石》中的代欧奇希斯、3DS Virtual Console的《水晶版》中的时拉比，可以在一般游戏过程中相遇并收服。另外，在《太阳／月亮》与《究极之日／究极之月》中，只要利用3DS内建的相机扫描特定QR码，不限时间与地区，都可以领取到玛机雅娜。
大多数幻之宝可梦都会作为精灵宝可梦电影的主角之一在动画里登场，它们在电影中也会有非常活跃的表现。
幻之宝可梦的特征
根据身高和种族值，幻之宝可梦大致可以分为两类。
小型的幻之宝可梦
这些幻之宝可梦身形较小，身高不超过1.0m：
小型的幻之宝可梦种族值总和通常为600，某些小型的幻之宝可梦6项种族值完全相同。它们通常在精灵宝可梦动画中表现为危机时就会发出强大力量的宝可梦，有时也会成为反派所觊觎的宝可梦。
大型的幻之宝可梦
这些幻之宝可梦身形较大，身高普遍在1.0m以上：
大型的幻之宝可梦种族值总和通常高于600。它们通常在精灵宝可梦动画中表现为拥有强大力量的宝可梦，时常会与其他强大的宝可梦进行对战。
特定时期内的幻之宝可梦
由于第二世代无法向第三世代传输宝可梦，使得洛奇亚和凤王在整个第三世代期间以及第四世代《心金／魂银》发售之前都只能通过官方活动或者与旁支系列游戏联动获得。这段时间内它们也被认为是幻之宝可梦。
幻之宝可梦列表
梦幻
梦幻拥有所有宝可梦的基因，被认为是现存的宝可梦中最稀有的宝可梦，有人甚至认为它是所有宝可梦的始祖。
在动画中，梦幻只出现在超梦的逆袭和梦幻与波导的勇者 路卡利欧中，动画里的梦幻同样神秘而不可预测。科学家并用它睫毛的化石制造出了超梦。
在第一世代的游戏中，梦幻仅仅出现于红莲岛的宝可梦屋的研究笔记当中，只有通过利用游戏漏洞以及后来出现的官方配信才能得到它。在第三世代中，通过正常途径的配信获得的古航海图可以前往梦幻出现的边境的小岛，这也是唯一一次通过捕捉得到梦幻的机会。
在特别篇漫画中，梦幻在VS梦幻中登场，并与小智和小茂进行对战，同时也是火箭队和小蓝的目标。小蓝的百变怪曾变为梦幻的模样。此后在火红·叶绿篇帮助小智控制住了火箭队的飞行船。
时拉比
时拉比拥有随意穿梭时间的能力，同时也是森林的守护神。
动画中，时拉比在电影时拉比 穿梭时空的相遇和幻影的霸者 索罗亚克出现。时拉比可以利用时间波纹在时间之中移动，随后时间波纹就会消失，而触碰到时间波纹的人会得到预知未来的能力，但也会让附近的植物枯萎。
在第二世代的游戏中，把钢铁调查过的ＧＳ球放在桐树林的祠堂内，时拉比就会出现。而在第四世代的游戏中，把时拉比带到桐树林的祠堂，它就会带着响声和琴音回到过去，见证火箭队解散时的坂木，以及在阿波罗宣布火箭队重生时阻止坂木回到关都。
在特别篇漫画中，时拉比在第三章是假面男为了穿越时间试图捕获的宝可梦。时拉比在第四章时，借助朱红色宝珠和靛蓝色宝珠的力量将路比和沙菲雅带到了千里等人没有死亡的未来。在第九章时，时拉比让时间缝隙中的柳伯看到了毁灭的未来，并让他逃出时间缝隙来改变未来。
基拉祈
基拉祈据说拥有实现愿望的能力，在一千年中只醒来七天，当腹部上的第三只眼睛——真实之眼打开时，就能实现他人的愿望。
动画中，基拉祈在电影七夜的许愿星 基拉祈中登场，并与小智等人相处了短短七天。期间，熔岩队的巴特勒不断从中*扰，最后还利用基拉祈吸收千年彗星的力量制造了形似固拉多的怪物。最终怪物因能量被基拉祈和小智等人反向传导回千年彗星而破碎。动画中基拉祈实现愿望的能力是通过转移他处的物质和能量实现的。
在特别篇漫画中，基拉祈是第六章故事最主要的传说的宝可梦，基拉祈身上的3枚许愿笺分别可以实现1个愿望。铠甲男许下愿望召唤了海之魔物盖欧卡，米拉特许下愿望解除了5位图鉴持有人的石化，亚希达许下愿望让对战开拓区热闹起来。
代欧奇希斯
代欧奇希斯是陨石上的宇宙病毒突变而成的宝可梦，来自外太空，会和陨石一起袭击地球。代欧奇希斯拥有在一般形态、攻击形态、防御形态和速度形态四种形态之间切换的能力，转换形态时附近会出现极光。
在第三世代的游戏中，代欧奇希斯会根据版本改变形态，在《红宝石／蓝宝石》中是一般形态；在《火红》中是攻击形态；在《叶绿》中是防御形态；而在《绿宝石》中是速度形态。连接对战时，《红宝石／蓝宝石》游戏会将所有形态的代欧奇希斯以一般形态的形象显示；《火红／叶绿》游戏会将速度形态的代欧奇希斯以一般形态的形象显示；只有《绿宝石》能够正确显示所有形态的代欧奇希斯。第三世代的代欧奇希斯是无法进行形态变换的，想要获得不同的形态只能通过连接交换，而从第四世代及之后的游戏中，代欧奇希斯可以通过各地的陨石来转换形态。
在动画中，代欧奇希斯在裂空的访问者 代欧奇希斯登场，因为是来自太空的宝可梦而被烈空坐视为入侵者，被攻击至只留有一枚绿色的核心。另一只紫色核心的代欧奇希斯为了寻找同伴而来到地球，与烈空坐混战。动画中代欧奇希斯能够随意地从一般形态、攻击形态和防御形态三种形态之间切换，也可以制造极光来与同伴交流。
在《火红／叶绿》和《绿宝石》，通过极光船票的航线所到达的诞生之岛上，有一块三角形的陨石，以最短的路径跟上陨石移动，直至陨石通红爆裂时，一般形态的代欧奇希斯就会从天而降。而在《欧米伽红宝石／阿尔法蓝宝石》，EpisodeΔ终章主角与超级烈空坐一同破坏坠向地球的巨大陨石后，三角形的陨石核心以和诞生之岛陨石同样的轨迹移动、变红，随后一只代欧奇希斯就在陨石核心的背后出现并与超级烈空坐对战。
在特别篇漫画中，坂木曾经试图控制代欧奇希斯个体二，为此甚至使用了尚未培育完全的代欧奇希斯个体一作为引诱，但被小智等人和超梦阻止。代欧奇希斯个体一因此变得无法转换形态并因此被火箭队丢弃。在第十三章，愤怒的代欧奇希斯个体一改变了巨大陨石——古兰陨石Δ的轨迹令其坠向地球以向火箭队复仇，最后被路比、沙菲雅和超级烈空坐击败。
达克莱伊
达克莱伊是梦与月的宝可梦之一，代表朔月和恶梦。在达克莱伊周围的人或宝可梦会受到它的影响而做恶梦，达克莱伊利用这种能力来确保自己的领地。
动画中，达克莱伊在决战时空之塔 帝牙卢卡VS帕路奇亚VS达克莱伊登场，因为能力的缘故，与附近的人类产生了误会。后来由于帝牙卢卡和帕路奇亚大战，时空变得破碎，达克莱伊与两者制衡来为小智等人争取奏响时空之塔的时间，在最后一刻因为同时承受时光咆哮和亚空裂斩而肉体消逝。最后，时空之塔奏响奥拉席翁，时空回复平静，达克莱伊也复活了。
在特别篇漫画中，萨奇曾经使用达克莱伊把小智等人石化。
玛纳霏
玛纳霏拥有和任何宝可梦都能心意相通的能力。它从海底出生，会本能地回游至自己的出生地。
动画中，玛纳霏在苍海的王子 玛纳霏登场，被称为苍海的王子。古代的水之民在玛纳霏出生地建造了海之神殿亚克夏，利用玛纳霏回游的本能引领通往神殿的道路。玛纳霏还是蛋的时候，就已经能够通过心灵互换和其他人交流了，孵化后，它很快地就学会了几个人类语言的词语。玛纳霏还拥有引领包括盖欧卡在内的各种居住在海洋的宝可梦的能力。
霏欧纳
霏欧纳是玛纳霏的后代。它会在海面上漂浮，就这样漂回自己的出生地。
霏欧纳的获得条件很特殊，必须要培育霏欧纳或玛纳霏与百变怪才能得到，而玛纳霏本身是幻之宝可梦，因此想要不通过官方配信活动或者与牧场联动，单机得到霏欧纳是不可能的，而且它也像其他幻之宝可梦一样无法进入对战设施。但因为其可以通过宝可梦培育在单机条件下无限得到，所以霏欧纳是否属于幻之宝可梦仍存在争议。
在特别篇漫画中，玛纳霏从蛋中孵出后就一直寄放在培育屋，后来它的旁边又出现了一颗蛋，那颗蛋最后孵化成为了霏欧纳。
谢米
谢米是象征着感谢的宝可梦。在钻石·珍珠游戏中的苑之镇有人说到，据说苑之镇以前不会开花，但谢米在这里施放了感谢的心情，从而使这里开满了花。
谢米也在电影骑拉帝纳与冰空的花束 谢米中登场。如果嗅到特定的一种花蜜，谢米便会变为天空形态去某处制造花田，这个规律会一直循环下去。
在特别篇漫画中，谢米是米依同行的宝可梦。
阿尔宙斯
阿尔宙斯被认为创造了整个精灵宝可梦世界。它创造了神奥地区神话的宝可梦帝牙卢卡、帕路奇亚和骑拉帝纳，并分别让它们掌管了时间和空间以及反物质。它也创造了由克希，艾姆利多，亚克诺姆，它们代表着知识，感情，意志。其它传说的宝可梦被认为是同时被创造的。
阿尔宙斯也在电影阿尔宙斯 超克的时空中登场。电影中，阿尔宙斯用生命之源转换成幽灵属性和火属性进而无效化了相应属性的招式，阿尔宙斯只要失去了其中一个生命之源，它的生命就不再是无限。它曾经用水，地面，草，电，龙的生命之源来制作了生命之宝玉。
在特别篇漫画中，阿尔宙斯是第九章故事中的主要宝可梦。
比克提尼
比克提尼能赐予人或事物超越极限的能力，在比克提尼与白英雄 莱希拉姆和比克提尼与黑英雄 捷克罗姆中登场。
在特别篇漫画中，布莱克帮助比克提尼脱离了等离子队的抓捕。
美洛耶塔
美洛耶塔是象征旋律的宝可梦，借由招式古老之歌可以变为歌声形态或舞步形态。
在动画中，它可以解除海底遗迹的封印，其中的现形镜能够让龙卷云、雷电云以及土地云变为灵兽形态。
在特别篇漫画中，美洛耶塔曾经与怀得和白露相遇。
凯路迪欧
凯路迪欧在酋雷姆VS圣剑士 凯路迪欧中首次登场，被称为三位圣剑士的后继者。
在特别篇漫画中，黑２·白２篇时黑次在誓约之林收服了凯路迪欧。
盖诺赛克特
盖诺赛克特曾经是生存在3亿年前的远古最强猎手，被等离子队复活后改造成为破坏工具，背后加装了能响应卡带的大炮。
在特别篇漫画中，盖诺赛克特曾经被等离子队控制，后来被国际警察黑次捕获，后来黑次也因为擅自使用盖诺赛克特的缘故被开除国际警察身份。
蒂安希
蒂安希在电影破坏之茧与蒂安希登场，在它的国家里有一个非常大的钻石在支撑着整个国家，但这个钻石可能就快崩坏了，蒂安希为了获得妖精气场的能力重造一个钻石来支撑国家而寻找哲尔尼亚斯。
在特别篇漫画中，路比在Ω红宝石·α蓝宝石篇和蒂安希相遇。
胡帕
胡帕在电影光环的超魔神 胡帕登场，拥有能够将任何东西拿出来的光环。在百年前严重破坏了荒漠市，被一位旅行者使用惩戒之壶封印为被束缚的胡帕。目前梅雅利和巴尔札在创世之谷照顾它。一开始被解除封印为被解放的胡帕会非常痛苦，但现在已能随意转换。
在特别篇漫画中，米拉特在Ω红宝石·α蓝宝石篇和胡帕相遇。
波尔凯尼恩
波尔凯尼恩在电影波尔凯尼恩与机关人偶玛机雅娜登场，和被人类伤害过的宝可梦们共同生活在远离人烟的尼贝尔高原上，非常讨厌人类。
玛机雅娜
玛机雅娜在电影波尔凯尼恩与机关人偶玛机雅娜登场，500年前由艾利法斯制造出的宝可梦，身体内潜藏著名为“魂心”的未知力量。
玛夏多
玛夏多在电影就决定是你了！登场，引导小智一行人前往凤王栖息的天青山。
细节
此前在海外，传说的宝可梦和幻之宝可梦均被称作Legendary Pokémon，直到《黑／白》官方网站才出现Mythical Pokémon一词。
海外民间亦称幻之宝可梦为Mirage Pokémon，但是战栗的幻影宝可梦出现的幻影宝可梦采用了此名。
在第六世代前，每个世代都会有一个每项种族值都为100的小型幻之宝可梦。
第四世代同时出现了两个这样的幻之宝可梦，分别是玛纳霏和谢米（陆上形态）。
谢米（天空形态）是第一个并非每项种族值都为100的小型幻之宝可梦。
第六世代前的幻之宝可梦中，只有代欧奇希斯没有在20周年纪念配信。
这可能是因为《欧米伽红宝石／阿尔法蓝宝石》中可以在游戏中收服到野生的代欧奇希斯。
