数码宝贝大冒险在1999年大获成功后，数码宝贝系列导演角铜博之于数码宝贝02完结后先后出版了无印和02两部小说，对一二部未提及的剧情进行补充以及对BUG剧情进行修正，这几年01的小说终于在中国出现，并有了中文版，不过不知道是不是因为翻译问题，感觉小说写得不是很好，本文来介绍一下官方小说和动画的剧情差异。
恶魔兽篇是小说与动画差异最小的一个篇章，小说补充了恶魔兽与猿猴兽、吸血魔兽均隶属于小丑皇的噩梦军团。
无限龙兽、木偶兽、钢铁海龙兽，还有小丑皇。全员都是究极体数码兽，企图支配数码世界。吸血魔兽和猿猴兽和恶魔兽也不过是其手下。
他们是黑暗四天王封印四大圣兽期间，统治数码宝贝世界的代理人。
在此期间，他们将数码世界的支配交给手下吸血魔兽、猿猴兽、恶魔兽等。然后，终于封印完了四圣兽，启动了世界再构筑的程序。
动画中虽然没有直接揭示恶魔兽与小丑皇的关系，但在45集恒常式附身在嘉儿身上提及过去的故事说起小丑皇袭击过他们，夺走了进化钥匙。
而在之前的集数，进化钥匙是被恶魔兽藏在海底洞穴，总不可能是恶魔兽去小丑皇那边偷来的吧？只能是小丑皇交给恶魔兽保管。
猿猴兽篇的差异之一是前面提到了猿猴兽是噩梦军团的成员，且地位尚在迪路兽之下，对手下称呼迪路兽为大人感到很不爽，嘲讽迪路兽是只成熟期的耗子（迪路兽初设是憧憬猫的老鼠，在2017年改回猫了），而动画中猿猴兽应该不是黑暗四天王手下，它和木偶兽互不认识。
猿猴兽表情稍微有些不爽：“不要叫那家伙什么‘大人’。因为那家伙可是比奴家低级的。”猿猴兽所说的低级是指猿猴兽是完全体而迪路兽是成熟期，在组织中并不是这样。这也是让猿猴兽不甘心的原因。
猿猴兽在小说中的结局是被机械暴龙兽先用三叉戟臂贯穿了腹部，弄出了个能看到背后蓝天的大洞。之后，分子兽制造的黑洞越来越大，开始吸收一切，其他被选召的孩子们在妖精兽的保护下成功撤离，而机械暴龙兽的左腿却被猿猴兽死死抱住，最后近距离的一发究极破坏炮将猿猴兽打入黑洞中。钢铁猿猴兽在小说中并未出场，也就是说猿猴兽的戏份在这里就终结了。
而小说与动画的另一个重大差异是在分子兽。分子兽在动画中不过是过场式角色，只是为了引出徽章，但小说中属于穿针引线、不可或缺的重要角色。
小说中的分子兽是噩梦军团的首席工程师，黑暗四天王征服数码宝贝世界后，以数码宝贝启示录中“螺旋之山”为蓝本，请分子兽设计的程式。这程式能够将数码世界所有的情报，以都市、森、海、闇四种对应四天王自己的属性分别进行世界再筑构成，小丑皇称为“再构成”，并且在世界正中央隆起一座四属性的螺旋山。黑暗螺旋山能够破坏创始村的机能，根本上停止数码世界的进化，更吸收天与地，甚至让＂火之壁＂开始减弱。
但分子兽生性叛逆，讨厌秩序，追求着世界混乱，因此对透过支配、让世界秩序化的四天王感到不屑，为了向四天王利用他一事复仇，所以入侵了＂火之壁＂，停止了火之璧一瞬的时间，启示录兽抓到机会跑到了数码世界，接着自己被启示录兽被拖进去黑洞，从此毫无踪影。最后他称呼了启示录兽一声“同志”。
太一从东京回数码宝贝世界重新聚集同伴这段剧情小说和动画基本一致，唯一的区别是巴鲁兽对战怪蛙皇时进化成完全体的花仙兽，并用一招花仙炮击败了怪蛙皇，而不是在之前的御台场对战黑暗巨龙兽中，可能导演自己也觉得巴鲁兽成熟期打完全体，完全体打成熟期有点不对劲吧······
仙人掌兽的身体发出金色的美丽光芒，就像南瓜变为马车那样，变成了有着粉色花蕾脑袋的可爱花之妖精。“仙人掌兽超进化，百合兽(Lilimon)！”百合兽用长在后背的四枚叶片做成的可爱翅膀畅快地一边在空中飞舞，一边躲开老爷怪蛙兽的攻击。然后，将看起来像是花瓣的两个手腕合拢起来，“花仙炮(Flow' Cannon)！”如此唱出了魔法的咒文。百合兽的手腕闪烁着放出了彩虹般的光芒，直击了老爷怪蛙兽。“呱~~~~~~”老爷怪蛙兽发出惨叫倒下了。
而吸血魔兽到了现实世界后，在御台场制造了一个结界，结界内力量增强了十倍，表现比动画更为强大，动画里虽然吊打六大完全体，却被天使兽一拳打跪，而在小说中则是一招恶魔血鞭将天使兽打飞，所有攻击都无法摧毁吸血魔兽的结界。
吸血魔兽丢出迪路兽，双臂伸出红色鞭子般的电击。「天堂之拳！」「凯撒锐爪！」天使兽和狼人加鲁鲁兽的必*技同时被放出。直击了。可是没有任何效果。「你觉得这里是哪里？」他挥舞了红色电击。天使兽和狼人加鲁鲁兽被吹跑了。「这是我的结界」下一击，让祖顿兽从屋顶掉了下来。「我的领土！」迦楼罗兽、阿特拉独角仙兽被扔到了海面。「把现实世界和数码世界，全都变为黑暗之物第一步就在这里！」在结界内吸血魔兽的力量，到达了此前的十倍。在他背后，「究极破坏炮！」机械暴龙兽的生体导弹直冲飞来。吸血魔兽的演技“咔！”地发了红光。导弹在吸血魔兽面前停止，粒子化后消失了。百合兽从死角中飞出架起双臂。「花仙炮！」然而，发射虹色光线之前红色电击就跑到其中，把百合兽和后边的金属暴龙兽打包弹飞了。
有得必有失，究极吸血魔兽的表现就没动画中那么神勇了，钢铁加鲁鲁的“优雅十字冻结者”和战斗暴龙兽的“战斗龙卷风”两发攻击已经让究极吸血魔兽支撑不住，随后两兽在补一发“绝对冷冻气”和“盖亚能量炮”直接把究极吸血魔兽打成粉末。
黑暗四天王篇是小说与动画差距最大的地方，小说描写这段剧情非常的赶，打完一个黑暗天王后马上打下一个，有点烂尾的感觉。此外，小说明确提及小丑皇封印青龙兽、无限龙兽封印朱雀兽，另外两个天王封印的圣兽对象未知。
钢铁海龙兽：动画中钢铁海龙兽用究极波浪炮*死巨鲸兽后被战斗暴龙兽用战斗龙卷风*死，而小说里钢铁海龙兽则用二百米将巨鲸兽活活绞死，然后以一敌三，大战黄金剑狮兽、战斗暴龙兽、钢铁加鲁鲁，三只数码兽向钢铁海龙兽同时发动进攻，黄金剑狮兽先用究极粉碎爪偷袭抓伤了钢铁海龙兽的一只眼睛，导致钢铁海龙兽瞄准失灵，即使如此，钢铁加鲁鲁和战斗暴龙兽都无法承受钢铁海龙兽的一发究极波浪炮，于是黄金剑狮兽用肚子堵住了钢铁海龙兽的炮口，钢铁海龙兽的头部被炸飞，黄金剑狮兽也与之同归于尽，虽然失去了脑袋，钢铁海龙兽却未死去，仍向战斗暴龙兽他们发动攻击，最终，战斗暴龙兽用恐龙克星把钢铁海龙兽剩下的身体，从脑袋根到尾巴切成了两半。
木偶兽：木偶兽戏份远没有动画中的多，一出场就与被选召的孩子们决战，首先是木偶兽VS战斗暴龙兽，一记爆炸铁锤即将拥有勇者之盾的战斗暴龙兽砸到退化成滚球兽。
之后原本已胜券在握，但木偶兽残*部下的行径，令阿和与加布兽感染上了黑暗之力，加布兽进化成钢铁加鲁鲁后力量暴增，如喷射战斗机般飞向木偶兽，用钢铁牙齿将其咬住木偶兽后直接飞到高空，随后一招冰狱冷冻气将木偶兽冻成了冰块粉末。
召唤大房子和操纵术这两大神技在小说中均未提及。
无限龙兽：至于无限龙兽与动画最大的区别是它在小说中无限大炮一次都没有用过，动画里无限大炮表现力有些捉鸡，连成熟期的巴多拉兽都没法打退化······
对决战斗暴龙兽时，由于战斗地点是在地下都市，因此无法使用无限大炮，因为无限大炮威力太大，随意使用的话都市世界本身都会被破坏掉。而超级计算机告诉无限龙兽，即使肉搏战，其力量也凌驾被选中的孩子们搭档数码兽全员的力量。结果没计算到恐龙克星，导致一命呜呼。
小丑皇：动画中精彩的女性对决是没有的，小丑皇一出场就把妖女兽、地狱小鬼兽、海恶魔兽、丧尸撒旦兽都叫出来围殴被选召的孩子们，不过没起到什么作用，被一波集火后灭掉了。小丑皇虽然单挑完胜战斗暴龙兽，然而不敌战斗暴龙兽和钢铁加鲁鲁的联手，最终被盖亚能量炮和冰狱冷冻气打成了数据。
小说中并没有小丑皇用魔术手帕将众人变成布娃娃以及被吸入天国之门的剧情。
动画中，启示录兽是进化的过程中消失掉的数码宝贝怨念集合体，不过小说中却是完全不同的设定。小说中的启示录兽是利用着消失掉的数码宝贝他们的怨念来达成自己真正的目的。
当把小丑皇的数据全部吃完时，启示录兽终于幻化成了人型。
小丑皇的数据残骸向那物体的方向，被操纵着流去。「发生了……什么……？」「在吸收」「吸收了到底会怎么样—」「我也不知道啊！」把小丑皇的数据全部吃尽时，那东西的身体发生了变化。一个突起蓦地出现了人型的东西。
与动画版不同的是，不止被选召的孩子们，玄内老人、妖精兽、奥加兽、安杜路兽、雪人兽兽等所有赶来黑暗龙卷山参战的数码宝贝们也参与了这次最终决战。
启示录兽先发制人，用声音震碎的神圣计划的进化徽章，为了让孩子们不失去希望，妖精兽舍身一击向启示录兽发动进攻，却被启示录兽了二重螺旋锁链活活熔化。不管是动画还是小说，妖精兽都起了至关重要的作用，以生命唤起了孩子们的信心。
代表希望的阿武率先尝试，天使兽在没有徽章的情况下成功进化为神圣天使兽，是的，神圣天使兽在小说中的戏份比动画少得多，作用似乎只是为了给众人带来希望。
被阿武的希望所刺激，其他们孩子们也纷纷尝试，与一人的心之徽章刺激大家的心之徽章同样，大家的心之徽章刺激了一人的心之徽章。也就是，互相掌握的精神性特质相互干涉。最终全员进化。
全员总进攻与消灭启示录兽的过程与动画一致。
最后感人的结局飞帽*小说中也是有写到的。
由于泪水嘶哑的声音拼命向美美道歉。但美美不可能不明白巴鲁兽的心意，「够了！够了，巴鲁兽！别了！还有，谢谢你！」美美高高挥起的手，撞到了粉色的牛仔帽。帽子脱离美美的头，被清爽的风吹没了……。
