作为一款以海盗为题材的生存沙盒游戏，《ATLAS》中最为核心的元素莫过于船只了。虽说游戏为玩家提供了十几种职位玩法，但是几乎没有一种是能够离开船只的，毕竟日常出行需要船只，展开海战需要船只，到处贸易也需要船只，因此打造船只是每个玩家都必须掌握的游戏玩法。随着游戏中人物等级的不断提升，解锁了技能点之后，就可以学习有关于船只打造的技能。
技能掌握得越丰富，能够打造出来的船只就越高级，在船只落成之后，当然并非一劳永逸了，还得给船只升级加点，并放置零部件，建造建筑塔。这些元素不仅仅可以美化船只的外观，还可以丰富或者强化船只的功能。在个性化船舶定制玩法中，栏杆模块和三类建筑塔是最为典型的存在。
栏杆模块的种类比较多，主要是增加船只的功能，还可以实现从贸易型船只到战斗型船只的转变。而建筑塔种类就比较少了，只有三种，分别是亚特兰蒂斯塔尖，工业发电机和诅咒塔的军队，每一艘船只上也只能够摆放一类建筑塔。三类建筑塔在外观和功能上都存在着很大的差异性，从一艘船只上摆放的建筑塔大致上可以了解船只的定位。
就比如亚特兰蒂斯塔尖能够为船只提供30%的速度加成，因此往往贸易型船只上会出现这类建筑塔。而诅咒塔的军队和工业发电机增加的是攻击力和防御力，所以一般被放置在战斗型船只上。合理地评估自己的船只，判断其定位，才能够为其放置最为合适的建筑塔。不少玩家都表示，《ATLAS》的船只改造玩法比现实当中改车还爽，能够更直观的看到载具的变化。大家在《ATLAS》中都为自己的船只放置了什么类型的建筑塔呢？
