是的，特殊使命大结局共36集。
因为该剧的制作方已经公布了该剧的总集数，并且该剧目前已经播出了36集，所以可以得出结论该剧总共有36集。
此外，特殊使命这部剧在探讨国家安全、反恐等主题时，融入了家庭、情感等元素，是一部扣人心弦的电视剧，值得一看。
第36集
07号柴云生用财色引诱机要室的刘参谋，并设计从刘参谋处复制了保险柜钥匙，地下党通过刘菊芳将钥匙交到巩向光手中。 按地下党的计划，一方面柴云生将刘参谋调虎离山，一方面巩向光进入机要室获取进攻延安的计划。但余沁斋(姚安濂 饰)的突然到来，使巩向光无法脱身。
在陈静雷的的协助下，巩向光终于拿到了计划并交给地下党。 巩向光的举动似乎证实了余雪瑶(蒋小涵 饰)的怀疑，余雪瑶当面说出巩向光的真实身份，并劝巩向光回头。在巩向光的劝说下，余雪瑶开始站在了他的一边。
边国烈召集巩向光重要会议，结果却是携他及一批军事要员秘密前往前线，准备开始进攻延安的军事行动，并确定了进攻时间。巩向光借旧病复发向家中索要药物，将写有情报的密信托人带给刘菊芳。
