在美国南北战争时期，两方人马是成天打打**。于是这天的战斗中，五个逃兵决定乘坐热气球离开这个是非之地。而这时的天空中正是狂风暴雨电闪雷鸣，大风卷着热气球是越飞越高越飞越高。也不知道飘了几天几夜终于降落在了一座荒岛上。
等几人挣扎着爬到岸上时已经失去了所有力气，而当他们睡了一夜后，再次醒来时却发现上尉不见了。他们也没着急找人，合计可能是昨晚风浪太大，上尉被淹死了也说不定。于是便准备找点食物果腹，结果发现小岛的生物有点特，生蚝的大小堪比西瓜，撬开壳尝尝鲜，别说味道还挺好。
就在其他人忙着享用美食时，老黑突然发现从远处升起了一缕炊烟。接着大家一股脑跑去查看，发现在篝火旁昏睡着一人，再仔细一看，赫然就是失踪的上尉。老黑叫醒了他，问道大兄弟你这是弄啥，咋还跑丢了呢？话说你这火是咋升起来的啊？上尉也是刚醒迷迷糊糊的前言不搭后语。但他却肯定地说道：这火不是自己生的。那这就奇了怪，不是你那会是谁呢？难道这岛上还有别人居住？算了，管是谁生的火，搭把手来把炭整走，咱回去吃烤生蚝。
饱餐一顿后，众人齐心合力建造了一个简易的住所。之后又拿起了自制长矛向森林的深处进发，准备打点野味。这一路上他们发现岛虽然小，但生长的植物却很高大。众人走了小半天，到达了岛的另一边，在这里他们发现一口喷泉喷出的还是热水。男人见状提议咱们泡泡澡吧，就当是泡温泉了。但上尉却说我也想泡温泉，可当务之急还是找食物，否则中午就要饿肚子了。
众人一听也有道理，于是便分头去捕猎。老黑和上尉一队，不过两人没走几步道就感到地面发生抖动，像是发生了地震。原来他们踩到了一只巨大的螃蟹。这是活了多少年啊？长这么大个，先暂且称呼它为大闸蟹吧。上尉自知不敌撒腿就跑，不料老黑被吓得腿软，刚跑起来就摔倒在沙滩上，下一秒巨大的钳子袭来，将老黑夹了起来。
眼看人就要被一刀两断，上尉赶来营救队友。其他三人一听了动静，纷纷赶来围剿大闸蟹。可是大闸蟹皮糙肉厚，长矛根本不起作用。还好尚未激动生智，让大家把大闸蟹赶到悬崖边，之后又将它打翻了过去。老黑这才得救。
再之后众人又合力将大闸蟹推下悬崖，不偏不倚掉进了温泉里。殊不知这泉水滚烫，幸好之前众人没有去泡澡，否则被煮熟的就不是大闸蟹，而是他们了。不过如此，一来午饭也是有了着落，温泉水煮螃蟹。众人吃的是大快朵颐，吃蟹肉就跟吃面包似的，一口下去满满的幸福感啊！
饱餐过后众人继续探索，很快就发现了一队羊群，得了知道晚饭吃啥了，烤全羊整起。与此同时男人呼叫大家，原来他发现了破碎的船只，一同被冲上岸的还有一个金发姑娘以及她的姑姑红裙大姐。男人先是唤醒两人，接着端来了吃剩下的生蚝，能看出突然出现的两名女人，让这群男人们感到了兴奋。一番交谈后得知，两人也是因为躲避战乱，所以坐船出海，结果遇上暴风雨，才沦落到这座小岛上。
安顿好女人后，上尉又带着大家继续探索小岛。他们发现了一处山洞，而从洞口落下的藤蔓，正好可以让人借力爬进洞穴。看样子绝不会是巧合，一定是有人故意这么设计的。说不定山洞里有人居住，抱着这个想法，众人进入到了山洞，他们在这里发现了遇难者的尸骨和他的日记。
根据日记上的遗言可知，这哥们也挺倒霉的，出海旅游遇到了海盗，海盗将他流放到小岛，他自知活不长久，于是便草草自*了。之后众人发现，这洞穴挺不错可以遮风挡雨，很适合用来居住。于是便开始了搬家。男人们还利用藤蔓制作了升降梯，方便女人们进出山洞。
这天老黑在海边，发现了一个箱子，好家伙全是有用的物件，有用来航行的望远镜、指南针，还有可以防身的两杆枪，甚至还有生活用的锅碗瓢盆，以及一本故事书。这让众人感觉箱子是有人故意送来的，否则箱子被冲上岸。里面怎么可能滴水没进，但无论他是谁，可以肯定的是。他想帮助俺们，有了指南针和望远镜，就能进行海上航行了，所以只要再造一艘船，大家就能离开小岛。
于是在接下来的这段时间，男人伐木砍树，忙着制作船骨，女人则保证后勤，平日里挤挤羊奶，做做饭啥的。可好景不长，这天一头巨大的火鸡闯入了羊圈。火鸡好像是吃激素长大的，体型宛如一头小型恐龙，娇生惯养的女孩。哪里见过这个阵仗，于是直接被吓晕了。火鸡将女孩踩在脚下，男人们见状上演英雄救美。这个憨批手忙脚乱，拿着棍棒打火鸡的屁股，反观火鸡根本不痛不痒。好在小伙及时赶至一个箭步跳到了火鸡身上，拿着小刀就是一通扎。也不知道扎了多少刀后，火鸡终于咽了气，一头倒在了地上。
事后众人将火鸡给烤了，可在吃肉的过程中，有人吃出了一颗子弹，奇了怪了。当时也没人开枪打火鸡，怎么会凭空出现一颗子弹。联系此前种种，上尉确定这岛上一定有人在暗中监视和帮助他们。而在经过英雄救美后，小伙成功获得优先择偶权，没事就和小女孩出去约会。
这天女孩无意间发现，石头上竟然流淌着蜂蜜，顺着蜂蜜的流向，两人来到了一座蜂巢。结果彻底被吓坏了，因为这蜂巢大的不像话，不用想蜜蜂一定也是个巨无霸，于是两人便准备离开。
可好死不死的是，蜜蜂在这时回来了，果然这是蜜蜂大的吓人，两人无奈之下，指向蜂巢内部跑去，结果脚下一滑，奇奇摔进了一处蜜道。而在密道的尽头，竟然停放着一辆潜水艇。出于好奇心的驱使，两人来到里面一探究竟。不看不知道，一看吓一跳，内室的装修极尽奢华，两人当即就不想离开了。
但转念一想，这可是潜水艇，有了它不就能离开小岛了吗？于是两人连忙返回基地，准备把好消息带给大家。但基地这边的众人，却遇到了大麻烦。一艘海盗船正向他们驶来，海盗们派出先遣队，很快就登上了陆地。不过上尉说到底是个军人，凭借着两杆链想竟然不费吹灰之力就干掉了登陆的海盗门。可他的开枪也彻底激怒了海盗头子。一声令下大炮瞬间开火，一颗又一颗炮弹纷纷砸向山洞。众人被吓得躲了起来，海盗则开心地手舞足蹈。
不料这时海盗船摇晃了起来，有人用大炮袭击了海盗，直接把船都干沉了，海盗们也全都葬身大海。而袭击海盗的男人穿着非常的奇怪，他头戴潜水帽，身后还背着个大海螺。男人自我介绍他的名字叫老白，是鹦鹉螺号的船长，也是一直暗中帮助大家的人。老白因为痛恶战争所以独自来小岛隐居。而岛上的巨大变异动物也都出自于他的实验。至于这次现身也是迫不得已，因为岛上的火山马上就要爆发了，他是来带大家离开的。
之后老白带着大家回到了潜水艇，他说潜艇中看不中用，因为没有燃料所以它根本启动不了想要离开小岛，只有打捞起海盗们的沉船。事不宜迟我们这就出发。于是众人身穿潜水服跟着老白来到了海下，可在修复海盗船的窟窿时一只章鱼怪突然出现。不过老白也是早有准备，他准备了一把激光枪，威力是特别的凶猛。章鱼怪自知不敌便掉头逃跑了。接下来众人修好了海盗船，然后返回潜水艇通知其余人离开。与此同时火山也开始了爆发，这场灭顶之灾比想象中来的要更快。
老白因为拿实验数据错怪了最佳逃生时间。等他准备离开时洞穴已经大面积坍塌，就这样他本人和他真爱的鹦鹉螺号一同葬身在了火海之中。另一边的众人则都安然无恙乘坐海盗船离开了小岛。
电影到这里也就结束了，这部电影名叫《神秘岛》。
