游戏中隐藏武将有赵云，马超，黄忠，徐庶等。
赵云的获得方法，黄巾起义剧本：此时赵云在野，搜索即可得到。赵云的出现时间是196年左右，出现城池在北平。群雄割据剧本：此时赵云还跟随公孙瓒，因此想要获得赵云有两个方法，一个是直接选择公孙瓒势力，赵云就在麾下，将赵云设置为储君，然后把公孙瓒送出去死了，让赵云当君主；假如是其它势力，攻打赵云所在城池，打败并且招降即可。
马超会从黄巾之乱和讨伐董卓两个剧本里出现，而且马超无法通过搜索得到。 他会在197年左右，自动投靠马腾所在势力。 如果在196年9月之前，马腾没有登场，马超不会在任何地方找到了。黄忠在186左右，就可以在长沙搜索得到。诸葛亮在208年3月之后，可以在襄阳搜索得到。当然，诸葛亮还可以通过“三顾茅庐”事件投靠刘备。
三国群英传3可以通过城市搜索得到隐藏武将。
