在《神雕侠侣2》中，不同门派各有千秋，难以简单评判哪个门派最厉害。
武当门派擅长内功心法和剑法，其招数精妙而且内功深厚，可以在战斗中起到不可估量的作用；峨嵋门派则强调内功修炼和掌法招数，尤其以万毒催眠掌闻名，可在战斗中毒害对手，迷惑敌人；少林门派则强调作为僧侣的义气和武学的修炼，习练少林心法、大力金刚掌等都是强大武功。总的来说，每个门派都有自己的特色和优势，厉害程度难以简单对比。
《神雕侠侣2》中各门派实力应该说是十分平衡的，但是在不同的领域中还是存在着差异。
丐帮虽然招牌技能“降龙十八掌”声名远扬，但是很多细节都被其他门派所超越；武当则以内功深厚而著名，但是其攻防技能稍嫌单调；峨眉派的“倚天剑”招数威力惊人，但是打出来相对有些慢；华山派招牌“独孤九剑”则是被楚留香完美发扬光大。综上所述，神雕侠侣2中哪个门派最厉害还需要根据游戏玩家个人喜好来选择。
