有一下四个原因
1、能见度高：地球大气的平流层水汽、悬浮固体颗粒、杂质等极少，天气比较晴朗，光线比较好，能见度很高，便于高空飞行。
2、受力稳定：平流层的大气上暖下凉，大气不对流，以平流运动为主，飞机在其中受力比较稳定，便于飞行员操纵架驶，并可节省燃油消耗。
3、噪声污染小：平流层距地面较高，飞机绝大部分时间在其中飞行，对地面的噪音污染相对较小。
4、安全系数高：飞鸟飞行的高度一般达不到平流层，飞机在平流层中飞行就比较安全。在起飞和着陆时，要设法驱赶开飞鸟才更为安全。
因为在云层上方，民航机要在平流层飞行，因为气流稳定，没大有明显的不和谐的气流。
只有在起飞和降落阶段，会遇到云层，但飞机飞行通常会尽量避开雨云区，在云层上方飞行，淋到雨的机会比较小，如果碰到暴雨，通常会延迟起飞或备降其它机场。平流层在海拔6000米以上，通常民航机的飞行高度就在6000-13000米之间，一般我们坐飞机出行，中型机巡航高度会在10000米一下，7000米以上，小型机可能略低，大型机可能略高。但是都在云层以上，云层不会出现在这么高的高空，这个高度已经空气接近无水状态了。
