他们已经没有武器可用了。
威廉想出了一个办法，他来到冥河号引擎附近，发现引擎仍然在运转。他一边躲避攻击，一边开始计数。他利用巨大的引擎压碎了第三架敌机，虽然过程十分惊险，但他们最终还是成功地躲过了一劫。库克当即表示需要返航，威廉也同意，但贝卡却不同意。她让库克在固定频道上发射信号，没想到立刻就得到了回应，是一个在敌占区内的坐标。
贝卡让他们前往坐标所在地，这无异于送死。库克坚决不同意，但贝卡和威廉都非常坚持，他也没有办法。于是，战机还是赶去了坐标地点。库克发现这里的宇宙辐射非常强，雷达基本不起作用。然而，当他们穿越小行星后，却发现了一支庞大的舰队。他们经过无线电应答得知，这里原来是人类的舰队。
当他们靠近时，库克和威廉惊奇地发现，这些战舰在资料中都已经被击毁了。贝卡告诉他们，这就是幽灵舰队计划，利用资料骗过赛隆人，然后将舰队隐藏在他们的眼皮底下，随时给他们致命的一击。
威廉三人来到了欧几里斯号，从指挥官那里得到了命令，要安全护送贝卡到冰雪星球。上面有一支特种部队在等待。之后的事情就不用他们操心了。
很快，欧几里斯号开始了空间跳跃，经过四次跳跃后，顺利地来到了冰雪星球附近。但更糟糕的事情发生了，附近竟然有一艘赛隆人的母舰。指挥官派出了两架战机来掩护威廉，其余的战机则与欧几里斯号一起，尽力拖住敌军的母舰。但是，敌人的部队实在太多了，欧几里斯号的武器舱口受到了损伤。
为了掩护任务的成功，指挥官当即下令全力撞击赛隆人的母舰。然后，他按下了核武器按钮，欧几里斯号与敌军母舰同归于尽了。另一边，三架战机虽然来到了冰雪星球，却被敌机紧紧地缠住了。为了完成任务，负责掩护的战机也选择了同归于尽。虽然敌人被尽数击毁了，但威廉的战机也受到了严重的损坏，只能被迫降落在冰雪星球上。
现在，他们失去了战机，想要成功返回只能依靠其他人的救援。于是，威廉决定护送贝卡和特种部队汇合。等完成任务后，再一起返回卡拉狄加号。他们长途跋涉，来到了预定的汇合地点——一个山洞。然而，当他们到达时，却发现这里到处都是尸体。库克几乎精神崩溃，吵着闹着要回到战机。
然而，山洞内部突然传来了动静。威廉上前查看，当他回头时，发现库克和贝卡掉进了岩洞。威廉绑上了绳索，试图救援，但绳索不够长，他只能跳入岩洞中。威廉猜测一定有其他的出口。然而，不等他们开始搜索，突然有怪物袭击了他们。库克被怪物扑倒了。由于他们贴的太近，威廉迟迟不敢开枪。此时，一个男人从天而降，一枪解决了怪物。随后，他带着三人离开了岩洞。原来，他就是在此地的特种部队队长杰斯。可惜，如今只剩下他一个人了。杰斯告诉他们，赛隆人在这颗星球上进行生物实验，这些怪物就是他们的试验品。杰斯的队友们就是被怪物袭击而丧生的。贝卡提出要前往目的地，但杰斯坚决反对。此时，星球正处于风暴中，而且还有赛隆人的巡逻队在外围。杰斯建议他们前往安全屋过夜，明天再出发。这个所谓的安全屋就是眼前的滑雪旅馆。赛隆人攻占这颗星球后，将这里改造成他们的储藏基地。随着战争的推进，这里很快被他们废弃。杰斯为了安全，在安全屋周围设置了地雷。他带着三人进入安全屋休息。夜幕降临后，威廉和贝卡谈心，得知贝卡的丈夫已经去世，而且他还是军队中的传奇人物。贝卡告诉他，丈夫根本不是什么英雄。当初，他第一次执行任务时，不幸遭遇队友的误*。为了树立英雄形象，军队高层才编造了这样的谎言。威廉感到非常失望。他想起了偶像的话。所谓的英雄都是骗人的。贝卡上前安慰他，两人之间的关系变得更加亲密。他们在彼此的安慰下，顺利地睡在了一起。
深夜时分，威廉听到钢琴的声音，他出去查看，发现是库克在演奏。两人之间的关系得到了缓解。就在库克调侃他和贝卡时，安全屋外突然发生爆炸，看来是敌人触发了地雷。
两人立刻进入警戒状态。威廉去寻找贝卡，却发现她已经不在房间，两人只能在黑暗中摸索前进。另一边，杰斯虽然勇敢，但还是被赛隆人击中，发出了痛苦的*声。贝卡慌不择路，来到了赛隆人的实验基地，发现这里到处都是人类躯体。很明显，他们试图通过研究人类来获得新的样貌。此时，一个敌兵进入实验室，发现了躲藏的贝卡。但他没有攻击她，反而开始扫描贝卡的项链。此时，库克赶到并开枪解决了这个士兵。
当太阳升起时，库克的精神已经接近崩溃。他持枪对准贝卡，逼问她此行的目的。贝卡为了保护自己，不得不告诉他真相。他们的最终目的地是一个赛隆人自动通讯矩阵，贝卡打算破解其中的程序，上传一个特殊病毒，以隔绝赛隆人之间的通讯。病毒就藏在她的项链中。得知真相的库克终于放下了枪。
三人来到了最终目的地，这里没有士兵看守，因为这里是自动通讯矩阵。贝卡轻松地进入其中，开始传输项链。不料，库克突然从背后袭击她，中枪倒地。库克情绪激动，声称贝卡是赛隆人的间谍。库克看到了士兵没有攻击贝卡，反而在扫描她的项链。随后，他看向屏幕，发现项链里根本不是病毒，而是幽灵舰队的位置和信息。威廉不知所措。就在这时，贝卡突然开枪击倒了库克。
事到如今，贝卡也不再掩饰自己的身份。她声称自己是为了结束战争，赛隆人只是被迫反击。当人类意识到无法取胜时，往往会选择和解。威廉不敢相信贝卡居然会背叛，她也曾目睹赛隆人的人体实验，难道这也是不得已而为之吗？贝卡已经走火入魔，完全听不进威廉的劝告，甚至一枪将他击倒。就在她要*了威廉时，手枪却没了子弹。威廉起身，抄起手枪，扫射设备，强制中断了传输，但还是泄露了大部分信息。威廉带着库克离开，留下贝卡自生自灭。幸运的是，最后关头，两人被救援部队发现，而贝卡则被赛隆人发现，此时他已经拥有一半的人类躯体。
虽然贝卡为人类立下了大功，但最终还是被残忍*害。威廉回到卡拉狄加号，舰长告诉他真相。原来他们早就知道贝卡的计划，于是故意设下陷阱，提前转移了幽灵舰队。趁赛隆人全部出动时，他们趁机重创赛隆人基地，取得了阶段性胜利。威廉因战功得到了新型蝰蛇战机。为了纪念即将退役的库克，威廉决定将战机命名为脱壳机，战斗仍在继续，但希望之光永不熄灭。
