诸藩的制度虽然各有不同，但都是以幕府的制度为蓝本的，就彷佛是一个小幕府。幕臣的最高等级是“大名分”，即禄高一万石以上，与大名同样领有官位，可以“守名乘”者。例如百万石的前田家，以五万石的本多播磨守为首，有这类藩臣十二人。其下依次是：年寄列，家老或中老，禄高一万石以下，是藩政的最高负责人。用人列，担任侧用人、用人、奉行者。番头、物头，番头是骑兵大将，物头是足轻大将，平时担任警备方面的工作。马回，大名的直属武士，平时担任各种职务，是藩政的执行者。徒士，即徒步武士，平时负责辅助马回。卒，同心、足轻这类低级武士，平时担任警卫等。中间、小者，战时各队附属的杂兵，并不算正式的武士，而只是奉公人。当然以上只是很简单的分类，实际情况要复杂的多。
武士本身并不像忍者这样分等级，如果说分的话，也是依照其身份(出任朝廷的官位、幕府的役职或主君家中职位)来比较高下的。
