危机纪元持续了两个世纪，最初几十年，人类处在慌乱中拼命摸索。接下来是大低谷，人类历史经历前所未有的全球大灾难，地表沙漠化、人口减半，社会秩序崩溃并重建。
经历迷茫、彷徨的人类文明，在大低谷后迎来科技大爆发。人类放弃被破坏殆尽的地表，在地下建立一座座新城。人类在基础物理之外的其他学科取得了长足进展，上千艘巨大的恒星级战舰建造成功，人类世界随之分为两个国际：传统的地球国际和新出现的舰队国际。原来的行星防御理事会被太阳系舰队联席会议取代，负责协调太阳系舰队总体事务。罗辑和史强也从冬眠中被唤醒，正在适应全新的生活。
危机纪元205年（即公元2215年），人类检测到一个疑似是三体世界的航空器正飞往地球。这个航空器表面整体外形酷似一滴眼泪，人类亲切地称之为“水滴”，并对其美轮美奂的外型赞叹不已。信心满满的人类以为，自己目前的科技与军事力量已经远超三体世界，三体舰队一定是派来了谈判的和平使者。
善良而又虚荣的人类经过协商，决定派出两千艘太空战舰，去太空彰显人类科技力量，共同迎接“水滴”对地球世界的造访。在派出“螳螂号”飞船对水滴近距离的考察后，科学家发现，水滴的表面，无论被放大多少倍，依然是绝对光滑的平面，它使用的，是一种人类无法想象的材料。
就在巨大的震惊中，水滴迅速启动了。它以人类舰队根本无法想象的加速度发动了猛烈攻击。像一颗能随意转向的子弹，水滴飞速洞穿一列列排成矩阵的密集战舰的舰体，碰撞带来的冲击力和超高温，使战舰尽数被毁。被历史称之为末日之战的这场战役，从开始到结束不到三十分钟，人类全部的太空力量，两千艘太空战舰根本还没开始还击，就遭遇几乎全部毁灭的命运，只有少数几艘战舰逃出生天。
后来的分析者在研究末日战役影像时震惊地发现，水滴在屠戮战舰不停转向时的速度已经超过了每秒钟一百七十公里左右。在强互作用力构建的水滴面前，人类战舰就像被针刺穿的气球一样不堪一击。
水滴，仅仅凭借自己坚硬的外壳和超快的速度，用最原始的撞击方式，就毁灭了人类的庞大舰队。
少数侥幸逃出的几艘战舰，很快发现了他们面对的残酷的宇宙生存法则。于是，已经流亡太空的地球舰队之间，爆发了黑暗战役，互相攻击争夺有限的资源。最后，“蓝色空间”号和“青铜时代”号两艘战舰幸存下来，驶往茫茫太空，为人类保留了最后一点生命的火种。
