经过隋唐时期，儒道佛三教合一大致成型。到元明时期，三教无论是思想上还是形式上都走向了融合，从而构成中国传统文化的主体部分。
持地菩萨众
在佛经中有持地菩萨，或云“其荷负众生，如地之能持万物。故名。”该画分两层，下层为持地菩萨主像，身后侍女手中所捧盆景山石，意在表现主题“持地”。上层画五位菩萨，合十而立。
随其所求令得成就大功德天特尊之主居色顶天摩醯首罗众
画中摩醯首罗天三头六臂，戴佩宝冠璎珞，跣足立于莲花之上，身后白牛，身左持宝珠者为随求天子。摩醯首罗天，又作自在天，原为婆罗门教之主神湿婆。
九天后土圣母诸神众
后土圣母是道教四御之一，史籍最早记载她是辅佐轩辕皇帝，管理土地的大官，汉武帝时在汾阴建立后土祠，从此祭祀后土成为国家礼仪。
水陆画《九天后土圣母诸神众》中的九天是道教三十六重天中的第九重天，后土圣母的居住地。画中十位女神像，名为神众，实则为人间贵妇的写照。她们面庞丰腴，细眉小口、双手持笏、注视前方，既雍容华贵，又威严庄重。
后土是中国古人对土地崇拜而信仰的大地女神，执掌阴阳生育，主宰大地山川，在人们心目中倍觉亲切和崇高，被视为“万物之母，大地母亲”。千百年来，民众为了生存达到丰衣足食、安居乐业的目的，建庙塑像祭祀地母后土，已成为历代民众极为虔诚的宗教信仰。
后土在传统上属于中国本土道教信仰的神灵，《九天后土圣母诸神众》就是这种融合的鲜活证据，文化艺术价值意义巨大，“给中国人的宗教信仰、哲学观念、文学艺术、礼仪习俗等留下了深刻的影响。”
大梵无色界上四天并诸天众
大梵天是佛教的初禅天主，同时也是婆罗门教为最尊崇之主神。画中共十人，分两层。大梵天胸垂宝饰，手持宝扇，立于靛青莲花之上。其后三人，二人持盘，一人捧经侍立。上层六人为诸天，或捧经卷，或合十而立，似妙龄少女礼佛于香烟缭绕之中。其中一人举袖凝眸而立，尤为婀娜多姿。
四海龙王诸神众
四龙王着袍服执笏而立，身后夜叉海妖随侍。佛教中原有“七龙王”、“八大龙王”的典故，后与中国本土的海神崇拜和道教信仰相结合，遂成四海龙王。
北极紫微大帝众
在道教神仙谱系中，最高的神为“三清”。三清指天神所居住的三处胜境，三处圣境又分别居住着道教的
三位至尊神，分别为：玉清元始天尊、上清灵宝天尊、太清道德天尊。这三请又有四位辅佐的天神，分别是：玉皇大帝、北极紫微大帝、天皇天帝和后土黄地。四御之首为玉皇大帝，其次是北极紫微大帝。北极紫微大帝位居天的中央，协助玉皇大帝执掌天地经纬，日月星辰及四时节气等自然现象，在中国古代民间极受崇拜。那么佛教在汉化的过程中,自然不可忽视这样一位执掌自然界的天神，所以在水陆画中，将他请进上堂，可见佛教在流传的过程中灵活变通。画中的紫微大帝，身穿人间皇帝冕服，两旁左辅右弼随侍，是人间君臣之像的写照。
阎罗变成泰山平等都市转轮大王众
阎罗、变成、泰山、平等、都市、转轮为十殿阎罗中的第五至第十殿阎罗，是古印度神话就已经出现的掌管地府的诸王。画面上人物皆持笏板，着朝服，戴方心曲领。
太乙诸神众
太乙神在汉代被称为尊神，唐宋时期对太乙神更加重视，谓：“太乙所在无兵役，人民丰乐。”太乙与西王母有关，据《集仙录》记载,西王母助皇帝讨蚩尤,王母派遣使者披玄狐之裘,以符授帝曰:“太一在前，天一在后，得之者胜，战者克矣。”
宝瓶金牛天蝎巨蟹磨羯宫神
道教对十二宫进行神格化，成十二宫神。由此也可知，在明代，西洋的天文学已影响中国的占星术，并为佛道两教所运用。画中诸神身份，以手中所持之物可表明。
五方五帝众
五方上帝分别对应五行五色，金木水火土、白青玄赤黄，白帝少昊金德、青帝太昊木德、玄帝颛顼水德、赤帝火德、黄帝土德。五方上帝又称五行帝，又皆为人帝，故又称五行人帝。
太阳木星火星金星水星土星真君
道教崇奉的六位真君。《太上洞真五星秘授经》以木、火、金、水、土称五星君，东方木德真君主发生万物；南方火德星君主长养万物；西方金德真君主收敛万物；北方水德真君主通利万物；中央土德真君主四时广育万类。六星均为道教中高照的吉星。
天龙八部诸神众
天龙八部为佛教神魔护法的主力军，天龙八部都是“非人”，包括八种神道怪物，因以天部和龙部为首领，故统称为“天龙八部”，其人数众多，掌管着我们生活的各个方面。是距离我们最近的佛教神明。同时也是最容易使修持者获得加持的神明。据《舍利弗问经》等载，天龙八部为：天众 、龙众、夜叉 、乾闼婆、阿修罗 、迦楼罗、紧那罗、摩睺罗迦。
