科技史专家李约瑟认为，人类早期，科学与迷信是没法区分的，古代的方术、巫祝就是最好的科学技术。以现代思维来看待古代文化，会割断历史文脉，造成历史虚无主义。
李约瑟与《中国科技史》
巫是知识分子的原型，中科院研究员陈梦家，中国国家博物馆研究员宋兆麟，清华大学研究员尤西林、台湾大学教授许倬云，台湾中研院院士张光直等认为：巫是知识分子的原型，是上古精神文化的主要创造者，对推进民族文化曾经发挥了重要作用。
巫文化是全世界人类的文化根基，古代巫师不仅是巫教和巫术活动的主持者，古代科学文化知识的保存、传播和整理者，也是掌握了最先进的生产技术、文化知识的特权阶级。
尽管巫师们所能掌握的科学文化知识具有很大的局限性，但他们是先民时代的智者是上古精神文化的主要创造者，并开创了后来的精神文明和群族文化。
宗教文化的源头。巫文化为在是世界各种宗教文化的源头。它对中国文化的推进具有不可忽视的作用，《周易》文化便产生于此，传统文化中的宗教、乐舞、天文、地理、历法、术算、军事、戏曲、文学、医学、技艺等，无不与其有关，推动了华夏文明的发育与成长。
早期的巫活动只是一种原始文化现象。原始的巫活动，产生于天象自然崇拜，认为万物有灵，祈求精神感召，得到各种生灵相助，或者能够知晓自然现象，明白上天意旨，祛病消灾，降幅佑人。这是先民思维方式和情感诉求的直接反映。
从自然崇拜到权力之争。随着生产力的发展，巫活动的原始古朴性渐渐丧失，被增加了人为成分，掺杂了许多个人的意愿。
为了树立绝对权威，王或巫师们开始把他们的先祖，或者直接把自己包装成神，首领兼具神性和人性，成为部族世代祭祀和崇拜的对象。商代以后，祭祀和崇拜的神，除了上帝和自然界的神灵，还有祖宗神。
这种对原始崇拜的“附加”，伴随着私有制的产生和权力的争斗，早在颛顼时期，为了实行思想统治，权力统一，就明令禁止所属辖区内的巫师或祭祀首领搞巫活动，这就是传说中的“绝天地通（《周书》）。
帝颛顼
所谓“绝天地通”即天地相分，人神不扰。这是一种有序化、制度化的文化秩序重建，这为儒家的礼制提供了依据，也为法家提供了根基，为神仙家提供了神仙的体系，为远古先民的历史提供了治世的思想基础。
“巫”的文明远古信息汉字有一个漫长的演变过程，不少汉字现在已经失去了它的原始意义，有的只保留了它的表面意义，比如这个“巫”字，多数人对它的第一印象跟封建迷信有关，实际上，这是一个极富文化内涵和丰富远古信息的汉字。
“巫”与“史”。在古代，巫是一个崇高的职业，即天官。黄帝出战，要请巫咸作筮，此后为历代沿袭，殷商时巫咸为官职，是中国最早的天文学家。“巫”的造字本义是贯彻天地，沟通四方，充当上帝与下帝(天子)之间的媒介。
从甲骨文到小篆，字形基本没变，造字原理是通天彻地
周公说：“惟殷先人，有册有典”，殷人的册典指的就是记在甲骨上的“卜辞”文化，包括祭祀、征战、天象、年成、王事，等等，古文字学家陈梦家认为，殷商王本身就是百巫之长，殷商文化其实就是巫文化，殷商的历史特质就是一部巫文化的“历史”。
“史”和“巫”一样，最初都是一种职业，“史”的原义是手持刀具在器物上刻字。“史”是将卜筮结果刻在龟甲上的人，相当于现在的记录者，后世称之为“捉刀”，他们是中国最早的历史学家，“史官文化”便由此产生。
史
《尚书· 金縢》记载：（武王有疾）史乃册祝曰……武王伐纣后两年身患重病, 周公作策书告神, 请代武王死。具体仪式, 由“ 史” 操办。这说明， “ 史” 已从“巫”或者“卜”中脱离出来，成为独立的职业。
《礼记· 礼运》云：“ 王,前巫而后史, 卜筮瞽侑皆在左右，王中心无为也，以守至正。就是说： 王者前有巫官，后有史官，卜筮之人和乐师谏官跟随在左右，王者处于中央，心思无需多用，只需恪守中正之道。
随着西周人文主义的日趋成熟，周王室对神的依赖大幅度降低，巫角色的重要性减弱, 卜的职能也逐步融入“ 史” 中。官史文化的进一步成熟, 使得《尚书》《诗经》等早期文献应运而生。
史，作为最有文化的阶层，奠定了中国史学最初的基石。
“巫”与“医”。汉代医学家张仲景说“进则救世，退则救民”，这句话是北宋名臣范仲淹“不为良相，便为良医”的最初版本。古代志士仁人把“相”与“医”相提并论，可见“医”在古代士大夫心目中的地位。
“医”字跟“巫”紧密相关，他的含义十分明了：医生本身就具有巫术的意义。
医
古代的“巫”都是兼职“医者”的，或者说这个职业里必须有医者，即道术之士，比如扁鹊、华佗，葛洪，孙思邈等等，皆是医者、道士。，屠呦呦的抗疟青蒿素，在传统中药“水煎”的方法失败无数次以后，受葛洪《肘后备急方》“绞汁”的启发，终于获得成功。
中医中药伴随着中华文明的第一道曙光走到现在，从神农尝百草，伏羲制九针，贯彻的治国救人思想从没离开过天人合一的整体观，大医治未病的无为观。道医说法是：再好的药，所起的作用都是以毒攻毒，没有营养这说，所谓“是药三分毒”便是这个道理。
冯友兰坚持在《中国哲学史》不没有突出道家思想，主要原因就在于他坚持认为：道家思想更属于科学技术史。他把这一主张跟英国科学技术史专家李约瑟交流后，道家思想对于医学的贡献，也成了中国科技史的重要篇章。
周代之后，巫文化进化成易文化，成为中华文明的根基。但巫文化作为周礼文化的补充，依然被朝野所接受，并发展为多种学派，成为诸子百家的源头。此后，中国的的本土道教、儒教即萌芽于此。
秦国一统六国后，为了统一思想，秦始皇“焚诗书，坑术士”。
汉武帝废黜百家，独尊儒术，把道、名、法、阴阳五行杂糅于儒家，原始巫文化被彻底边缘化。
但作为世界文明的源头，巫文化在人类的精神抚慰和引导方面的力量十分强大，这也是各种宗教得以发展生存的原因，它的副作用是为江湖术士提供了生存的空间。
传统的不一定都是封建的，随着优秀传统文化的复兴，一些在民间广为流传，为人民群众喜闻乐见的巫文化传统项目再一次被挖掘整理出来，有些还被列入国家非遗项目保护下来，比如古代巫咸国，今天的重庆市成立了“中国华夏巫文化研究院”，《巫舞》被列入重庆市第一批市级非物质文化遗产名录，河北、贵州、湖南等地，不少地方的傩戏入选国家级非物质文化遗产名录。
