你有没有设想过我们所在的宇宙，其实是某个巨型生物体内的一个细胞，又或者是一种病毒？
在2018年有这样一部以人体细胞为题材的动漫横空出世，通过拟人化+科普的形式将人体37兆2000亿个细胞拟人化，让细胞不再只是一个代名词，而是一个个鲜活的生命。它们在我们体内勤勤恳恳，无休止的工作。而我们的身体内部，也不再是红色幽暗的世界，而是有着现代化特征的都市，它就是《工作细胞》。
故事发生在我们身体内部，一群红细胞正在负责在血液内搬运氧气和二氧化碳，因为其含有大量血红蛋白顾呈红色。然而看似安全温馨的人体内部的世界，却处处充满危机。这时远处血管内壁被一股不知名的力量撕开，待周围的尘土散去。一群肺炎链球菌从洞外涌入体内，因为人体内部的温度对于这些细菌来说，简直是天堂一般的存在。
为了占领这里，它们朝着周围的红细胞们发动猎*。在这千钧一发之际，一群白色身影拦住了链球菌的进攻。来者正是我们体内的白细胞，又名嗜中性粒细胞，它们是免疫系统中最大的防线，游走在我们身体各处，驱除由外部入侵体内的细菌和病毒。
就在众人以为危机解除时，一只侥幸逃脱的肺炎球菌，却在背后酝酿着更大的阴谋，小红继续自己的工作，她推送着氧气物资朝着肺部赶去。然而第一天上班的她，对于人体的路线不是很熟悉，经常走错路。最后歪打正着间小红来到了脾脏所在位置，这里居住着美丽的巨噬细胞小姐姐，他们是白细胞的一种。告别巨噬细胞后，小红拿着人体地图朝着肺部走去，因为路痴的缘故，导致他不小心来到了7号仓库，小红被吓得落荒而逃。
然而身后的链球菌可不是吃素的，三两下便将小红逼入了绝境。还好小白及时出现，链球菌自知不是其对手，直接甩出浓烟和一张巨网将它们困住，随后逃之夭夭。原来这张网名为荚膜，是细菌分泌出来的一种保命手段。
小白在见到荚膜时脸色不禁一变，因为链球菌一旦拥有荚膜，就代表着他不是普通的链球菌。如果不及时将其消灭，他就会开始分裂，引起肺炎等呼吸系统的疾病，甚至会顺着血管去攻击各处器官，引发肺炎球菌血症，导致人体突发高烧，严重的还会引发脑膜炎，性髓膜炎上恐3。
如果放在平时的话就没事，但现在这具身体的免疫力正在下降，所以链球菌的存在就是一个定时炸弹，为了抹除这一潜在危险，小白联系同伴请求支援，然而这时他头上的雷达突然*，发出警报，这说明那只逃跑的链球菌就在附近。为了阻止病菌进入肺部，两人只好继续寻找。路上他们被一群可爱的血小板拦住去路，在得知这群小可爱被货物拦住去路后，他们也是十分热心的帮忙。
离开之际小白察觉到哪里不对，自己头上的感应器一直有反应，却始终没有见到病菌，难道是坏了吗？这是广场大屏幕上开始播放紧急新闻，辅助T细胞司令收到了链球菌逃到血管内的消息，目前肺炎球菌逃到了血管内，的确攻击立马派出*伤性T细胞和淋巴细胞，精英对其进行追*。
话音刚落，一群黑衣猛男迎面走来，他们就是T细胞和淋巴细胞，外号病毒*手。
·红白两人继续朝着肺部走去，途中小白始终没有遇到链球菌，于是两人便分道扬镳，小红推着物资朝着所在房间走去。可她刚一进房间，箱子便传出异样的声响，还不等小红有所反应，链球菌便从箱子中钻了出来，眼看小红就要沦为链球菌的食物，危急关头小白从天而降。
原来他与小红分开后，感应器就恢复了正常，于是便猜到了其藏匿地点，好在及时赶到。链球菌自知不敌，趁机扰乱视线逃离现场，而外面这些红细胞，自然全成了他的目标。好在小白及时出手阻止了链球菌，原本想一击将其秒*，然而对方拥有夹膜使他根本无法近身。
这下局势逆转了，小白只好带着小红拼命逃离。链球菌并不想放过两人直接追了过去，殊不知恰好落入小白的圈套，他按下一旁的按钮。紧接着一旁的机器开始运作，将链球菌困在胶囊中。
最后一双大手将链球菌送进喷嚏火箭，随着火箭的发射链球菌也被送出了体外。就这样在37兆2千亿个细胞的努力下，这具身体又迎来了健康的状态。
