一只萨戮得宝可梦意外发现了一个人类婴儿。它因为要养婴儿可可，退出了自己的族群。故事开头由此展开........
婴儿可可逐渐长大，对自己的身世也产生了疑问，自己到底是萨戮得还是什么？于是他离家出走，来到人类世界，遇到了小智。
可可最终知道了自己是人类，因为他父亲萨戮得他会宝可梦的语言，因此也为小智还有市民们解决了许多问题。
为了寻找自己的父母，他们来到研究所，从教授那里得知父母早已过世，而教授为了利用可可找到生命之泉，通过跟踪可可来到了萨戮得的丛林，教授开始了自己的阴险计划。
他用自己造的机器人开始对生命之泉的老树攻击，为了保护丛林，萨戮得和可可还有小智一起开始了反击。其中可可父亲萨戮得差点为救可可丧失生命。
最终他们阻止了教授，可可也明白了自己本身的意义，他决定出去闯荡......
故事的插曲自然也是少不了我们最可爱的坏人火箭队啦，他们无形中也做了好事......
父爱如山，感染着我们的不是单纯的剧情，更多的是可可和萨戮得的父子情！
