《浪客剑心》的故事主要是讲述，日本明治维新政府建立后的第十年，京都附近的在一处小村庄，出现了一名自称“千人斩拔刀斋”的剑客，四处作案，并于现场留下神谷活心流的信息。作为神谷活心流继承人的神谷薰，不得不自己想办法证明清白。于是某一天，追踪凶手的神谷薰偶遇手执逆刃刀的浪客绯村剑心。
被神谷薰收留的剑心也于此后认识了成天打架猛男相乐左之助，无依无靠的女医师高荷惠，旧武士遗孤明神弥彦等人。
以日本明治维新时代为背景，描述有着“拔刀斋”称号的名剑客绯村剑心，在决心不再*人之后流浪于日本各地，并认识了神谷道场的代理师傅神谷熏等人，展开另一段的传奇故事
