进入迷宫后一开始发现身处一片沙漠之中，随后乘坐摩尔加纳变身的卡车前往远处的金字塔（这里有一段福利 CG 可看），到达金字塔后从正门进入到遗迹之中，遭遇双叶的阴影，发生对话之后自动脱出迷宫。
潜入路线确保再次进入迷宫之后，还是从正面进入金字塔内，调查被封印的大门，却发现无法前进，之后再次和双叶的阴影对话，剧情后回到金字塔入口处，从い点东面的高台出向远处眺望发现有座小镇“沙漠之镇”，前往那里继续调查线索。
本次迷宫里敌人能力强化不少，尤其是同时拥有祝福和咒怨双属性即死技能的敌人“亡魂裁量者”（アヌビス）威胁巨大，主角一旦被击倒就 game over，建议合一只防即死的 PERSONA 随身带着，比如26级女教皇“伊西丝”（祝福咒怨双无效）。
沙漠之镇
首先在 C 点的广场发现盗贼，之后会有一个追击盗贼的事件，这里只要把盗贼尽量逼回广场使其无路可逃即可，之后 BOSS 战（暴力鸟神）
暴力鸟神
- 弱点：铳
- 反射：风
BOSS 会使用风属性魔法“加尔达因”，伤害很高，不要上带风弱点的同伴，用枪械攻击可以轻易将其打 DOWN 之后总攻击消灭。
击败盗贼获得「被偷走的莎草纸」之后一路回到金字塔中的大回廊处，和双叶的阴影对话，获得地图「金字塔的结构图」，随即发生剧情，主角一行中了陷阱掉落到了地下空洞之中。
地下空洞
沿着 う点 — え点 — お点 — か点的顺序一路向上爬，如果一下子找不到路就用 L1 键观察周围是否有感叹号，从地下空洞来到地下通路，这里有两条路，一条是在す点出来可以回到金字塔的入口处，建议先存档休息，再次回到地下通路中，前往 D 点，遭遇 BOSS 战。
长眠石棺的王侯(モト)
- 弱点：风
- 无效：祝
- 吸收：咒
BOSS 的弱点是风，带上摩尔加纳用风魔法猛打即可，BOSS 会使用万能魔法 米吉多 和特殊技能 袋中鼠，“袋中鼠”会把我方一人变成老鼠状态，一定时间内无法行动（传闻这里摩尔加纳被变成老鼠的话会发出疑似皮卡丘的语音，声优梗，不过当时作者并没有注意，有兴趣的朋友可以自己试试），另外 BOSS 还会召唤小怪 盘踞回廊的蛇女(ラミア)，弱点是冰结。
爬上墙壁，一直到F点按下开关，打开G点处的封印大门，进入“石棺之间”。
石棺之间
在阿努比斯像（A 点）处获得“深渊的宝玉”，之后在 B 点处的第二个阿努比斯像处获得另一个“深渊的宝玉”，从 う点 处来到上回廊上层，在 C 点石头台座处装上两个奈落宝玉，大回廊的大门会打开。一路前进来到 D 点的 safe room 处休息，之后可以从 え点 前往“拒绝之间”。
拒绝之间
首先一路前进会遭遇阴影双叶，对话后发现前面是个大坑，无法前进，只能向南在E点打开机关，在F点处的阿努比斯像获得“拒绝的宝玉”（不能先去南面获得宝玉），将拒绝的宝玉放到 G 点处的石像接触开关，H 点按下开关打碎石壁，之后跳下从 お点 前往大回廊上层。
在 I 点调查反射板后出现一幅拼乱的巨大壁画，把壁画各部分调整到正确位置后拼出完整壁画来后，封印大门消失，可以继续前进。
拼图解谜：中间的图块移动到最右，最左的图块移动到从右数起第二个位置，最左的图块移动到从左数起第二个位置。完成图：
从上方跳下后继续前进，来到 safe room 休息，之后从 か点 前往“自责之间”。
自责之间
在 K 点遭遇阴影双叶，之后由于不断滚动的巨大铁球挡路，无法前进，从L点的洞中钻到另一侧大厅（O点），M点放倒木板架桥，调查N点石板后显示 “B01010” 的消息。
之后回 O 点的大厅中有蓝色棺材那一侧的灯，将之排列成 “蓝色棺材/关/亮/关/亮/关” 的顺序（B=blue，0=关灯，1=开灯的意思），按下 P 点开关，Q 点的门就打开了。
之后向东北前进，R点的石板调查获得“R01100”和“B10011”的信息，按同样原理回到大厅，在红色棺材一侧排列成“红色棺材/关/亮/亮/关/关”，“蓝色棺材/亮/关/关/亮/亮”（R=red的意思），之后按下开关可以停止大铁球的运转。
爬上去之后从铁球上方连续跳跃通过再次来到大回廊上层。和之前一样，利用反射板照出排列错乱的壁画，之后将壁画恢复原状后封印大门打开，可以从上层跳下继续前进。
拼图解谜：
从右数第3块（右3）移动到最右（右1）→ 左3到右2 → 右4回转 → 左2回转到右6 → 左3回转 → 左2回转到左3 → 左1回转
完成图：
庇护之间
在巨大的陷坑处（V 点）从左边墙壁的洞爬到另一侧。在西南侧房间（W点）按下第一个开关，之后在到 Y 点房间按下第二个开关（调查发光的棺材），这样在 Z 点处就会出现第三个开关，出现隐藏房间，在隐藏房间的阿努比斯像处获得“庇护的宝玉”。
之后从地图西北处的石棺（け 点）爬上来到上层，在 b 点的台座处放上庇护的宝玉后，在上层出现发光地板作为通路，来到 c 点处跳下，进入 safe room，之后在 safe room 前的房间会遭遇BOSS战。
依然是长眠石棺的王侯(モト)
- 弱点：风
- 无效：祝
- 吸收：咒
还有两只杂兵：回廊中的蛇女(拉弥亚) 、洞穴中的蛇男(娜迦)，娜迦的弱点也是风，战法和之前基本一致。
从こ点爬上，来到 e 点处的阿努比斯像获得庇护的宝玉。
之后从 safe room 前的房间的北面（さ点）爬上，在台座处放上庇护宝玉，同样出现浮空发光地板，从发光地板通过往南在 g 点处按下开关，破坏墙壁，之后し处通过被破坏的墙壁，来到大回廊上层。
依然是通过反射板照出错乱的壁画，进行壁画排列解谜，顺利完成之后封印大门消失，调查最里面的门后和双叶阴影对话，发生剧情后脱出迷宫，之后可以发预告状了。
拼图解谜：
从左起第一格下部图块（左1下）用L1回转到右1上 → 左2下用 R1 回转到右1下 → 左2上到右2上 → 右2下用 R1 回转2次 → 左2上用 R1 回转到中央上 → 中央下用 L1 回转 → 左1下用 R1 回转2次 → 左2下用 R1 回转2次到左1下
完成图：
和之前不一样，这次发出予告状后当天就能直接进入迷宫，直接传送到大回廊最后的 safe room。调查发光台座后进入“虚之间”，在最内侧遭遇 BOSS 战。
BOSS：支配殿堂的魔物
- 弱点：无
- 耐性：无
BOSS 主要攻击技能以物理为主，辅以目眩和绝望的异常状态。其中绝望状态下无法行动，同时每回合会掉 SP，3回合后死亡，十分可怕。
摩尔加纳的 “梅帕特拉”可治愈目眩状态、新岛真的“能量浴”可治疗绝望状态，同时可以在女医生诊疗所里购买 リラックスゲル 以防备新岛真中异常时的状况。
战斗中 BOSS 会飞上天，物理攻击无法命中，只有枪击和技能可以命中，同时 BOSS 会使用“急速上升”飞到高空，我方无法攻击，2-3回合后会急速下降使用“狮身女猛击”，伤害巨大，建议 BOSS 急上升后我方保持防御状态，在使用过一次“狮身女猛击”后，会发生双叶加入的剧情。
双叶加入后 BOSS 会使用一次全体绝望技能“战栗尖叫”，要注意。
双叶会在 BOSS 急上升后发动“狮身女猛击”前给予我方预警。同时战场上出现一架弩车，可以指派队友中的一人去发射弩车攻击 BOSS，派出队友2回合后，弩车可发射弩箭击落BOSS，这时可以使用近战物理攻击对 BOSS 造成极大伤害，2回合后 BOSS 恢复飞行，重复这样的过程2到3个循环后就可以顺利击败 BOSS。
文中地图截图来自 spwiki.net/persona5
