1.曹州牡丹园
西门
东门
曹州牡丹园位于菏泽城东北部人民路、花园路之间，始建于1957年，1982年改建，2002年扩建，总面积100公顷，是世界上面积最大、品种最多的牡丹园。
目前，曹州牡丹园面积已达1600亩，牡丹品种1237个，芍药品种600多个，其他乔、灌木、地被植物共计200余种，是目前世界上牡丹、芍药种植面积最大、品种最多的植物园林。为拉长旅游链条，促进菏泽文旅产业发展，2021年牡丹节期间，曹州牡丹园将在白天观赏牡丹的基础上，点亮“夜游模式”，其中包括时长50分钟的大型水上实景演出《曹州吟》、灯光秀表演《梦幻曹州牡丹园》、牡丹仙子巡游。
曹州牡丹园建筑风格汇古今中外于一体，既古色古香，气势恢宏，又坦荡开阔，洒脱大气。
西大门是仿明代组合建筑，排楼十斗、三昂、重翘、绿瓦、歇山顶；立柱以上，全木卯榫结构，仿古彩绘,金碧辉煌，上书原中国书法家协会主席曾任中共山东省委*的舒同亲笔“曹州牡丹园” 5个镏金大字，熠熠生辉。排楼两旁，配套八字宫墙，连结古式配房，青砖筒瓦，翘角飞檐。整组建筑古朴壮伟，浑然一体。
迎西大门排楼，高竖纯铜铸造的“国花鼎”，高5米，重5吨，鼎上是一颗硕大的铜明珠造型，铸有该园1053个牡丹品种名字，以此将积淀深厚的民族历史文化和接古通今的悠长牡丹文化巧妙地融汇一起。
曹州牡丹园的中央建筑是宏伟耸立的仿古建筑观花楼，楼名由曾任中国书法家协会主席的刘炳森题书。登楼四顾，千亩牡丹花海尽收眼底。楼前的“天下第一香”碑，被誉为“三妙碑”：一是大书法家爱新觉罗•傅杰的书丹妙，二是当地名士何淑淦的跋语妙，三是政协名士刘月亭的撰联妙。
观花楼南有“国花馆”，徽派建筑，别具一格，总面积4500平方米，由清华大学和中央美院联合设计，是世界上第一座牡丹博物馆。内设序厅、历史厅、鲜花厅、牡丹精品厅、文化艺术厅等。鲜花厅由中国花协牡丹芍药分会会长王莲英教授亲自设计布展，在这里，一年四季都可以看到盛开的牡丹。牡丹精品厅是世界上牡丹品种最全的图谱库，展示牡丹品种达1056个。
牡丹广场位于牡丹园的偏东部，总面积8000平方米。主题造型“国花魂”高16米，直径14米，由中央美院设计制作，以抽象、含蓄而洒脱的精美造型，象征古老而年轻的菏泽历史悠远又生机勃发。广场上9根高9米、直径1米的文化柱石，饰花岗岩高浮雕精美图案，反映了菏泽市五千年的文明史。
广场西侧是再现的雷泽湖。据传，我们的祖先虞舜曾“耕历山，渔雷泽，陶河滨”，所讲三地均处菏泽。这次牡丹园大扩建，又开挖30000平方米的人工湖，为先祖谋生的古代湖泊复名，实为千古雅事。湖中饰有音乐喷泉，9个主喷头，56个小喷头，喷高达30米，组成8种不同美丽图案，在七彩灯光照射下，缤纷璀璨，使人如入幻景。
牡丹广场西邻，“国色无双，天香独步”景点，是立体的牡丹观赏区。此处牡丹采取九级台阶式逐步升高栽种，直达土山之巅。盘山石阶路侧，以玉兰为主，合并而成花瓣路，合欢、石南、火辣、华山松、红叶李和木本绣球点缀其间，使游人盘旋曲径花层间，体品“天香夜染衣”之雅感。
过牡丹山、服务区，便是牡丹园中的“梅林石韵”。这里新种梅树近千株，配以千奇百怪的天然巨石200余尊。每石必有精妙书法题写的奇名雅号，令人神思逸想，寻味无穷。
观赏牡丹的主景区，是观花楼与国花馆之间的牡丹大田。每当谷雨时节，各色牡丹竞放，九大色系，十类花型，千余个品种，其鲜、其娇、其艳、其香、其姿、其态……实为国色天香，无与伦比。一望无际的花洋花海花世界的接天势派，使游人无不如痴如醉，为之倾倒而流连忘返。万花丛中，是素白组雕“葛巾玉板”，更把人带入那无限美妙的神幻仙境。
盛世牡丹荣。今天的曹州牡丹园，不仅“牡丹甲天下”，而且满园景点变幻无穷，“花之语”、“花之韵”、“花之魂”、“花之海”、“花之潮”五大景观区，花海潮涌，山湖辉映，奇石疏林，曲径通幽……向游人提供的不仅是赏心悦目的园林之游，而且是内涵丰富的文化之旅。
2.菏泽百花园
菏泽百花园原名曹州百花园，位于菏泽城北郊牡丹办事处洪庙村，与“曹州牡丹园”、“古今园”、“凝香园”合称“菏泽牡丹四名园”。
此园与规模宏大的“曹州牡丹园”隔路相望，园仅百亩，却源远流长，婉若园林大族中“小家碧玉”，独具情姿，引人入胜而流连忘返。
据记载，此园原为明朝万历三十八年(1610)进士、工部尚书何应瑞所建，购田30余亩，广植各色牡丹和其他花木，当时民称“尚书花园”。几经沧桑，至清末时代，已易主曹州总团练郝省谦。郝又在四周遍栽桃、梨、柿等果木，园内增植牡丹、芍药珍稀品种和其他奇花异草，并打井修塘，养殖金鱼、鲤鱼，时称“郝家花园”。每年阳春时节，繁花似锦，车水马龙，宾客云集，盛极一时。后因连年战乱，天灾人祸，花园萧条败落，民国时期已诸花凋枯，几为荒野。
新中国成立后，洪庙村民重振祖业，在旧园址复种牡丹、芍药，很快聚零成片，恢复建园，名为“洪庙花园”。1982年政府拨款扩建，更名“百花园”。1990年，进一步定向性再扩建，园内面积达百亩，经南京园林设计院专门设计，内建古式迥廊、花亭、喷泉、塑雕，定名为“菏泽百花园”，集中栽植世代传留下来的牡丹珍品，大力培育名贵牡丹新品种。至今，该园已拥有精品牡丹20多万株，珍贵观赏芍药10多万株，红、黄、兰、白、黑、绿、紫、粉及复色共九大色系、560余个品种。其中一株明代牡丹，高4米，冠5米，老枝苍劲，绿叶葱笼，每年硕花400余朵，被称为“牡丹之王”,盛开时如锦如霞，观者无不加额叫绝。由该园“花艺掌门人”孙景玉耗17年心血培育的珍奇新品“景玉”牡丹，其花硕大，玉洁冰清，通体似玉，金蕊沁香，凛冽袭人，被誉为“白牡丹之极品”。至今，孙景玉老人亲领园工培育的牡丹新品种已达400余个，其中“乔子红”、“向阳红”、“曹州红”、“景玉白”、“水晶球”、“青香玉翠”、“金星雪浪”、“絳幕隐玉”、“碧天蓝月”、“贵妃出浴”、“青龙镇宝”等70余种，已被列入珍贵牡丹新品种，曾在国内外重大花事展赛中获大奖、金奖、银奖、冠军奖、一等奖、新品奖、科技进步奖等780余项次。1999年昆明世界园艺博览会，共设牡丹奖项111个，此园独得52项之多。
菏泽百花园虽源于数百年牡丹古园，但不固步自封，通过“请进走出”，引入日本等国优良牡丹品种“金宝”、“金阁”、“太阳”、“花王”等数十个；又走出家门、国门，在苏州、杭州、广州、上海等大城市和日本、美国、荷兰、新加坡等国进行名贵精品牡丹、芍药展览与交流，吸纳古今中外牡丹精华，使此园愈加精品荟萃。
2002年9月中旬，中国首批200粒“太空育种牡丹”种子在“曹州百花园”落户，这是世界上第一批“太空育种牡丹”。
“牡丹太空育种”主要是利用太空环境中宇宙射线辐射、高真空、微重力等综合因素的作用，使牡丹种子出现某些地球上无法获得的变异，从而大大提升牡丹的品种质量，在花色、花型、株型、叶型、花期等方面实现质的突破。
这200粒种子于2002年3月25日--4月1日，随“神州三号”飞船在太空中围绕地球飞行了108圈，经过6天零18小时，完成了人类首次在失重条件下对牡丹进行的太空变异实验。
200粒太空牡丹于2002年9月中旬播种后，10月份开始生根，生长良好。2006年4月首次开花，太空牡丹比现有牡丹品种花大，色泽艳丽，抗性强，花期长。
3.古今园
古今园位于菏泽百花园南一公里处，是距城区中心最近的一处牡丹园。古今园前身是明代万花庄村民创建的“万花庄花园”，园内主植牡丹、芍药，间植其他花木。花园经明末战乱，日渐荒芜。至清代乾隆年间，王梨庄（万花庄后改名）人岁贡王孜诵（号花村）重修牡丹园，编制松坊、松狮、松羊等。后因天灾人祸，花园又一度萧条。清末以后王世族人屡次重修牡丹园，所植牡丹远销北京、南京、苏州、杭州、香港等地。民国初年，花园被曹州府武备张培荣据为己有，改名军门花园。日寇侵略及国民党统治时期，天灾人祸，民不聊生，花园几近荒废。
解放后，花园回到花农手中，牡丹栽培面积年年扩大，花色品种不断增多，逐步走向繁荣。1982年，政府又拨专款重修花园，因其阅古历今，饱经沧桑，故名“古今园”。以后又多次拨款新建了民族特色的园门，古朴典雅；白色花园围墙，颇具现代园林风格；拱桥流水，假山喷泉，相映成趣。园内花卉面积50余亩，种植牡丹优良品种300余种，另有芍药、腊梅、迎春、月季、玫瑰、丁香、海棠等奇异花木几十种。培育200余年的松编牌坊——孜诵坊，壮观优美，堪称一绝；松编狮、虎，惟妙惟肖；树龄200多年的龙头槐虬枝盘旋；100多岁的翠兰松，如烟似雾；200多年的线柏，江北只此一棵；金丝吊蝴蝶树，春末开花，秋季花朵成为蝴蝶状，如万条金丝垂吊着一只只蝴蝶，十分奇特。因其松编造型独具特色，1985年，国务院派人专程把古今园培育的两队松编动物运往北京，栽于中南海紫光阁前。
4.天香公园
位于菏泽市中心区的天香牡丹公园，1990年修建于中华路北侧赵王河东岸。公园占地24.62公顷，园内景观植物以牡丹为主，拥有“玉版白”、“豆绿”等珍贵牡丹180余种。景区松柏森森，竹林苍翠，花水相间，园林小道曲径通幽。园内建筑古朴典雅，天香亭白龙盘柱，天香湖碧波荡漾，动物岛百兽相戏，游乐场妙趣横生。
每值假日，天香公园成了孩子们嬉戏玩耍的乐园；每日晨昏，这里又成了人们休闲健身的好去处；每当牡丹花期，位于菏泽城区的天香公园，像洛阳王城公园一样，各色牡丹盛开，色彩艳丽，花香四溢，吸引着成千上万的市民一睹牡丹芳容。
5.何家花园
又名“凝香园”，位于菏泽开发区岳程办事处岳楼行政村。花园现存留40亩，其景观大致分三大部分：何氏宗祠、何家碑林、园内各类奇花异草。这里种植着菏泽人引以为傲的牡丹和生长了数百年的松柏、丁香、腊梅，它曾为古曹州最精美的私家花园，是我国古代北方八大名园之一。菏泽久负盛名的绿牡丹、黑牡丹也源于何家花园，何家花园见证着菏泽牡丹的发展历程。何家花园在“姓”何之前，已经存在数百年。据说，隋唐时代就有此园，正式建于宋代。宋代此园名叫“东皋园”，是曹州府第一游览名胜。元朝时蒙古族袁姓占据此园，取名“正春园”。后来袁家败落，被明万历三十八年进士、工部尚书、菏泽城东何楼村何应瑞购得，后人开始称其为“何家花园”、“何园”。园内有600多年的凌霄树，400多年的桧柏,数百年的腊梅和1000多年的翠松，附近的何应瑞墓地桧柏成林，苍郁参天。
6.盛华牡丹园
位于菏泽市牡丹区黄堽开发区宋楼村南，为成立于2008年的山东盛华农业发展有限公司所建。该园占地面积2066.48亩，包括牡丹观赏园900亩、文化园120亩、釆摘园1000亩；牡丹展览馆6000平方米，影视艺术中心15000平方米，生态餐厅8000平方米，各种旅游设施10000平方米。
7.中国牡丹园
位于牡丹办事处大郭集村，北靠220国道，东临京九铁路，最初规划时命名为“菏泽国际精品牡丹园”，是继曹州牡丹园、百花园、古今园三大名园外菏泽的又一重点牡丹园，后改名为中国牡丹园。栽植牡丹芍药品种900余个、80余万株，赵粉、东方金、海黄、首案红等为珍稀品种。占地1200亩，计划投资6.2亿元。主要建设牡丹芍药种植园，着力于搜集、整理、鉴定、保护、栽培牡丹芍药种质资源，油用牡丹品种的培育、推广及开发利用，建立健全牡丹全产业链生态发展模式，推进牡丹产业化进程。中国牡丹园建成后，将成为世界最大的牡丹品种保护、繁育基地和牡丹观赏基地。按照项目设计，为营造四季有花、园区常绿的景象，中国牡丹园内除了种植牡丹、芍药外，另外将栽植菊花20万株、薰衣草60万株、腊梅11万株及油菜花等，还有被荷兰誉为国花的郁金香，园内引进郁金香20万株，分七块片区，分别为蓝、绿、粉、紫、黑、黄等六种色区及混搭区。
8.冠宇牡丹园
冠宇牡丹园位于牡丹区临商路（鄄城路）黄堽镇马厂北邻，园内有460亩的精品牡丹, 500多个品种，还有百年牡丹、几十年生大棵牡丹。
