夜尽天明
故事紧接上季，从天明的一个噩梦中开始，也正好对应了第一季结尾处天明的封眠咒印发作，正值深夜，盖聂与墨家头领再商量事情，三位小主角开始了墨家机关城的“游玩”，结果来到了墨家禁地的门前，由于徐夫子的阻拦，才打消了天明和少羽的好奇，但是在后面的剧情中三人却会携手走进这神秘的墨家禁地。与此同时，机关城外正在一场血雨腥风的厮*，大铁锤的雷神锤本身足够霸道犀利，但是身处森林并不利于招式的发挥，所以一度被隐蝠压制，危急关头，高渐离与雪女前来救援，赶跑了隐蝠，救回了大铁锤，但是流沙黑麒麟也伪装成墨家子弟成功的潜入了墨家机关城。
大铁锤与隐蝠激战
墨家禁地
流沙头领卫庄也带领着秦国重甲兵，开始从城外森林向机关城进军，墨家派出了白虎机关兽进行阻敌，而就在这时，公输家族的机关蛇也赶来帮助攻克机关城，这也是公输家族的机关兽首次登场与墨家机关兽进行正面对抗，继而另一角色公输仇登场。
白虎对战机关蛇
机关城中，高渐离首次面对面遇见了盖聂，由于高渐离与荆轲交好，而世人都认为是盖聂*掉了荆轲，所以高渐离对盖聂始终充满敌意，认为盖聂是嬴政派来作内应的，就在这紧急关头，班大师等一众人为盖聂证明，这才罢了，而端木蓉紧张的神情也被雪女捕捉到，这也说明她对盖聂的感情进一步加深。
高渐离敌对盖聂
端木蓉担心盖聂
黑麒麟在班大师通往密道的途中袭击了班大师，并且拿走了机关密室的钥匙，偷走了机关城的设计图纸。少羽给天明扔了一块由布包裹着的石头，让他去铸剑池汇合，但是天明识字不多，所以打算去找月儿，走廊中，天明遇见了高渐离和雪女，并听到高渐离说认识自己的父亲，但为了照顾天明的感受，高渐离并没有告诉他荆轲就是他的父亲，这也使得天明情绪变得十分激动。与此同时，班大师遇袭的消息传来，让各位头领感到十分不安。天明和月儿来到了铸剑池，少羽早就在此等候，但是再回忆起咸阳宫时，天明的咒印突然发作，月儿想到可以用真气疗伤，但是天明的咒印太深，反而将月儿反噬，危急时刻，端木蓉和徐夫子赶来才化解危机，随后三位小主角被端木蓉带走。
班大师遇袭
月儿疗伤
另一边高渐离在密道中遇到了由黑麒麟易容的端木蓉被骗回去保护班大师，结果在走廊遇见了端木蓉一行人，他才恍然大悟。另一边黑麒麟将致命的毒药鸩羽千夜投放到中央水池，却被徐夫子撞见，黑麒麟为了使得机关城内讧，变成盖聂的样子，袭击了徐夫子。高渐离在得知这一消息后，本就对盖聂不满的他，更加气急败坏，两人也是以刀兵相见，虽然盖聂解释，但高渐离已完全失控，眼看两人之间的战斗进一步升级，端木蓉出现为盖聂证明清白，但是盖聂还是被高渐离反锁在屋子中，天明赶到后对墨家囚禁大叔行为十分不满，而被点穴，带到了隔壁的屋子。
黑麒麟幻化成盖聂行凶
盖聂高渐离刀兵相见
这一夜并未发生其他事情，但是更大的危机却悄然而至，第二天分外鲜红的朝阳也预示了机关城将要受到重创的结果，端木蓉在看见朝阳后，也是突然醒悟，水中之毒正是受到阳光照射才会挥发毒性的鸩羽千夜，但为时已晚，多数墨家子弟都已经中毒倒地失去了战斗力，另一边天明受到了毒药的影响，而导致喉咙难受，盖聂得知后，让天明靠近窗口用教给他的呼吸法进行呼吸，这里也是透露出了，盖聂将鬼谷绝学之一的鬼谷吐纳术教给了天明。而天明人小鬼大更是爬出了窗外，来到了盖聂的窗前，但是盖聂考虑到天明不能一直站在窗外，让天明自己爬到与悬崖相连的走廊处，天明也是不负期望的成功跳到了走廊的把手处，但是这里却被安了致命的机关，好在少羽，月儿等人的赶到才化险为夷。
天明获救
另一边卫庄率领的秦国重甲兵也是攻克了机关城防御进入到了城内，墨家子弟开始与秦兵对抗，但是由于受到了毒药的影响，墨家显然不是对手，而在第一部中出现的苍狼王也再次登场，差点给天明一行人带来伤害，好在高渐离及时赶到，一剑封喉*掉了苍狼王，才化解危机，但是随后赶来的卫庄，凭借着更高的战力，打退了高渐离，墨家人马为了保护机关城，等候巨子的归来决定退守机关密室，但黑麒麟乔装潜入。另一边由于外面敌军数量实在太多，端木蓉带领着三个孩子来到了墨家禁地，并让他们进入到禁地当中，而自己则在与隐蝠的战斗中被俘。
高渐离击*苍狼王
端木蓉被俘
卫庄等人已经率军来到了中央大厅的门外，为了消耗秦军的兵力，则让秦军进入受到墨家机关的攻击，而公输仇更是将第一部中死去的无双加以改造变成了机关无双，无惧外伤的损耗，战斗力也大大的增加，给墨家带来了更大的困难，为了使得墨家人心涣散，卫庄则是以流沙计时，每消耗掉一层流沙便*掉一名墨家子弟。禁地中，三位少年凭借着智慧与配合通过了虎跳，猿飞，龙吼等关卡，还得到了阴阳家的幻音宝盒，而在墨问的路口，少羽被挡在了王道，天明和月儿被挡在了侠道，这不但让三个孩子分别应对接下来不同的关卡，同时也预示了今后不同的人生路。在接下来的关卡中，双方都顺利通过，而且少羽获得了破阵霸王枪，天明获得了墨家的至尊武器—非攻，天明与月儿又经过与公输仇的斗智斗勇之后，三人再度成功汇合。
机关无双
机关城中央大厅，墨家为了使巨子能够获得此刻机关城的危机信息，决定派出盗跖去报信，而在途中还遇到了白凤的追击，碰巧遇到了天明，少羽，月儿驾驶着白虎赶来帮忙，而公输仇则是驾驶着机关蛇与之对抗，三个少年最终战胜了公输仇，三人回到机关城，在走廊处，天明与月儿碰见了月神，月神抓走了月儿，视线回到机关城大厅内，在盗跖从密室出去后，黑麒麟使得关门机关被卡，让机关无双有了机会来阻挡石门的关闭，高渐离，雪女，大铁锤三人也被迫出来与卫庄等人对抗，而这时流沙的最后一层也已经流光，正当卫庄准备*掉端木蓉的危机时刻，盖聂出现，化解了危机，所有人都预料到他将于卫庄展开一场大战，也就是在这时，白凤回到机关城，向盖聂投出羽毛飞镖，被端木蓉拦截，但端木蓉也就此身受重伤，盖聂怀抱端木蓉的场景可以说是整个第二部最经典的一个镜头了，端木蓉的内心独白也透露出了她对盖聂的感情，而盖聂那深邃的眼神仿佛也在回应着端木蓉，经过了一段回忆之后，盖聂再度与卫庄开战，这时“天明”跑了出来，并站在盖聂面前，盖聂为了保护天明让他站在自己的身后，让所有人都没想到“天明”竟然将匕首刺向了盖聂，随即对应了第一部中月神的预言，第二部结束。
卫庄盖聂
聂荣。。。
大叔心碎的眼神
“天明”背后捅刀
回顾整个第二部，绝对是目前为止的五部作品中，剧情最紧密的一部，虽然比第一部要多了8集的内容，但是时间的跨度却并没有第一部长，如果不算天明的那几段回忆的话，可以说是一点没有拖拉，但是回忆的片段，也恰巧证明了天明正在成长。而如此紧密的剧情内容也为接下来第三部中的双方大战做足了准备。（未完待续）
