金丹功的修炼与人们所熟知的内丹修炼截然不同。近代丹书只言炼精化气、炼气化神、炼神还虚及还虚面壁之说。
而金丹三元加炼最上大成之真，妙一、三一、九炁，炼虚化炁，炼炁化精、炼精化神及炼虚合道之秘则从无见说。
金丹功可分为四个阶段，第一阶段为炼虚化炁，第二阶段为炼炁化精，第三阶段为炼精化神，最后阶段为炼虚合道。其整个过程，与人们所熟知的炼精化气、炼气化神及炼神还虚之说恰恰相反，相差一环。
第一阶段，首以抉破真源法，以感生妙一。抉破真源一法最为严秘，若不知真源，无以能知妙一；不知抉破之法，无以能至妙一。妙一乃金丹之母，大道之根，此乃心心相印，祖祖相传之秘，知得妙一即晓玄关端的，复以玄关橐龠法化生三一九炁。玄关橐龠法历来丹书稀有提及，然诚为求金丹至秘至妙之法，金丹真传中虽用其说，但未详其法。玄关橐龠亦含三层妙意，言其法度有大小高低之不同，会得其法，三一无有不生之理。三元即立，三元各有三炁，以成九黑，九黑归宫则炼虚化炁功成。
功成效验：行功得手，窍位则有发涨、发痒、发热、发凉等感觉。继而感觉窍位空空洞洞，犹如晨雾薄纱似的淡白光出现，日久光着，并出现黄赤紫绿碧等光不断变幻。随之便出现一梅花状的景象，上下稍短，左右微长，中间浑圆，内粉白色，外为黄赤碧绿各色缀现，甚为美丽。继而是一派碧水蓝天，或现月印碧空，晨星出海，水浮金莲之景。其际窍位有溶化之感，并微微开始跳动，不久妙一出现，初则感觉微弱，渐渐明显，似灵球在悠然自运。第一步功成，上中下三田必产生灵动之机，灵机自运不待人为。功到其际，周身舒泰，情志畅悦，百病皆除，工作耐力信心巨增。此步功一般须百日可成。
第二阶段，在第一步功成基础上，以盘古开天法炼厢化为阳精；出精光化生金丹，完成炼炁化精之功。盘古是上古时一位人君，得道后深明宇宙生成天地之理，遂用盘古以为名，阳炁化为阳精出精光，玄元始三炁化出三光为三阳开泰，三阳开泰化生金丹，为炼炁化精一步功成。
功成效验：行功得手，身中百脉畅通，窍窍皆开，真气涌跃，身体常有飘浮之感，耳中常闻悦耳之音，真阳之炁化成阳精发光，随后形成华光炫丽的金丹。外观形容，体泰神悦，行步轻捷，面色生光，目光夺人，对镜自照可见目中发黄赤之光，和他人对目凝视，他人亦可见之。此步功有一昼夜成就者，有七日成就者，亦有一年三年之不等，关键在于定力之差殊矣。
第三阶段，在第二步基础上，以九龙蟠珠法育化仙胎，以成炼精化神之功。《太平经》中引述老子降生时的景象曰：“……即诞之旦，有三日出东方，已育之后，有九龙吐神水以浴其身”。所言三日者，即三阳开泰之说；九龙者，非真龙，而是九阳真炁化成九彩华光环拱神胎。古人所说的九鼎神丹也是此种隐喻，此炼精化神一步功成。
功成效验：行功得手，金丹化为胎神，阳神成象，自鉴神容，耳中常闻清亮之仙乐声，眼内时有金光闪现，神光笼罩于神室，心花开放，自欣自喜，志气飘然。外观形容，神清骨秀，色似华英，时有丹香飘溢，身轻体健，行步生风，异于常人。此步功须一年成就。
第四阶段，金丹九九八十一化，功成乃是金丹全部工程完工。佛家九九归真即是指此一段功夫而言。此一步，功极理奥，不待解之，只靠学者功到自悟自证。
金丹功的修炼只言尽到此，然古今不泄之秘今已泄其七八矣。至于各步功中的致要之处，只能留给那些知音有缘之人用心去寻求。从古至今，学人无数，而成者寥寥无几，皆因学人自迷自误而又误人，不信金丹有口诀，皆依丹书去搜寻，按图索骥，背道而驰，愈趋愈远，中道而泯，或为区区小法小技而自钦，虽妄自辛勤而至遗误终生。君不见先祖言：“阅尽丹书万万篇，末后一句无人传”。这末后一句即是吕祖所言炼虚合道之功。曾不闻吕祖云：“炼虚功夫，妙在忘形，无人无我，混沌中有一点灵炁，身热似火，心冷如水，炁行如泉，神静如岳，虚其身心去其作用，而听诸大道自然之运行”。此三元加炼最上大成之天机。
金丹大道，按其实际修炼内涵，筑基之前，有男修女修、性修命修、有病无病；年老年少下手之不同。筑基之后则万法归宗，修炼归入不二法门。故门派不同，乃有术语定名之不同，分阶认识之不同，下手修法之不同，除此则无不同也。
