第一大缺点：油耗较高。Jeep指挥官在越野能力方面表现出色，但由于它越野性能强大，所以它的油耗也较高。对于一些注重经济性的消费者来说，它的油耗可能成为他们不购买Jeep指挥官的主要原因。
第二大缺点：悬挂系统噪音较大。Jeep指挥官的悬架系统还需要优化，有些消费者反映在行驶时会出现噪音。这对于有些消费者来说是不可接受的，他们对车辆的静音性有较高的要求。
第三大缺点：空间不足。Jeep指挥官的车身长度只有4.3米左右，车内空间相对较小。对于一些需要经常搭载大量人员或长时间旅行的消费者来说，Jeep指挥官的空间显然不足。
第四大缺点：噪音隔绝效果不佳。Jeep指挥官的隔音效果还需要进一步增强。在高速行驶时，发动机噪音会传到车内，影响车内人员的驾驶体验。
第五大缺点：后排座椅不够舒适。Jeep指挥官的后排座椅相对较硬，长时间坐在上面对身体不够舒适。这对于一些对长途乘车舒适度要求较高的消费者来说是一个亟待解决的问题。
第六大缺点：基础配置不够丰富。Jeep指挥官在基础配置方面还需要加强。例如，目前的普通版本并没有提供前、侧气囊及侧安全帘等安全配置，导致消费者在购买时需要额外花费来增加车辆的安全性能。
不能够根据战场的突如其来变化，做出迅速的调整
