独立日卷土重来。
这是一个类似蝗虫的外星种族，它们肆无忌惮地穿行在宇宙中，专门入侵资源丰富的星球，然后将其消耗殆尽，以此来增强自身实力。在20年前，它们曾派出拓荒者来到地球，结果没想到人类大获全胜。人们使用外星人留下的技术创造了先进的防御系统，并在月球上建造了防御基地。
然而就在今天，被囚禁在51区的外星人突然变得异常兴奋，这是20年来从未有过的现象。大卫立即前往中非一探究竟，进入飞船内部，大卫意外的发现外星人曾向太阳系外发过一条求救信号，地球的位置早已经暴露，一个巨大的漩涡毫无征兆地出现在了月球基地的上空。
下一秒，一艘球形的飞行物从漩涡中心缓缓浮现，整个外形与人们脑中出现的符号极为相似。此时地球也收到了消息，各国领导以为是外星人入侵，便纷纷同意先发制人。球形飞行物被成功击落，并坠毁在月球背面的陨石坑中，经过检测并未发现生命的迹象。
大卫觉得圆形物体与20年前的外星人根本不是同类，于是跟随勘探队前往坠毁现场查看。在这里他们发现了一个奇怪的白色球体，大卫打算把它带回51区。可就在这个时候，一艘巨型外星飞船缓缓露出身影，飞船的直径长达4800公里，这个体积比20年前的还要庞大数十倍，强大的引力正在撕扯着月球，整个月球表面尘土飞扬，陨石冲天而起。
关键时刻，大卫等人开启拖船并抓起白色球体逃离现场，基地立即发射激光炮进行反击。不料外星飞船依然有强大的护盾，人类的武器根本无法打出伤害。当外星飞船的能量汇聚完毕，它的重武器立即被激活。随着一发等离子炮射出，整个防御基地瞬间被摧毁。庞大的外星飞船擦着月球的表面向地球飞去。
20年的时间，收到求救信号的外星人组队重来，地球将再次陷入危难，人类该如何反击？
