没人能想象到，曾经那个让人闻风丧胆的顶级特工史密斯，竟然变成了一只鸽子，而且还是一只母鸽子。这可真是有点尴尬啊。作为中央情报局最厉害的特工，他今天的任务是夺回黑帮大佬手中的箱子，里面装着一架能无形*人的*人无人机。
突然间，史密斯以极速冲浪的方式炫酷登场，迅速击倒了黑帮大佬的手下。然而，这只是冰山一角，因为大佬的手下机械男放出了成百上千的小弟。面对如此众多的敌人的同时攻击，史密斯毫不畏惧，因为他身上藏着各种顶尖的微型*伤性武器，拿出任何一个都足以击败一群人。
然而，史密斯当场傻眼了，小弟们竟然一个都没有倒下，反而全都被空中闪烁着金粉的猫咪迷住了，连史密斯自己也陷入其中。直到感受到冰冷的刀子贴在他脖子上，他才恢复意识。眼看着机械男带着箱子要逃走，史密斯打倒了一波小弟后，迅速取下袖子上的纽扣，扔在地上瞬间变成了一个飞行陀螺，冲破屋顶追上了直升机，并成功夺回了箱子，完成了任务。
回到基地后，史密斯愤怒地冲向武器研发室。他想看看是哪个胆大包天的家伙调换了他的武器。然而，他却发现这个家伙叫做汤姆，是一个怪胎般的天才发明家。然而，汤姆发明的东西并不能伤害敌人，只能用来保护自己。他之所以不研究*伤性武器，完全是因为他对和平的热爱。这与史密斯的期望完全不符，他想要的是能够一招制敌的*伤力武器，而不是所谓的善良和仁慈。因此，史密斯决定将汤姆开除，但没过多久他就开始后悔了。他从机械男手中夺回来的箱子竟然是空的。与此同时，机械男不断利用*人武器行凶，而监控画面显示的竟然是史密斯的面孔。史密斯意识到自己被机械男陷害了，但没有人相信他的话。调查组下令封锁整座大楼，追捕史密斯。他只能逃走，转眼间，他从一个顶级特工变成了通缉犯。这一切来得太过突然。
面对调查组的追捕，史密斯突然想起汤姆曾提到他正在研究一种能让人消失的发明。于是他决定去找汤姆，试试这项发明的效果。与此同时，被开除的汤姆也在不断努力着。经过无数次的试验和调试，他终于成功调制出了一种隐形药水。为了证明这药水是否有效，他将鸽子的羽毛放入药水中，不久后羽毛真的消失了。汤姆兴奋地大叫起来，然而史密斯突然到访，尽管他开除了汤姆，但汤姆还是非常礼貌地询问他是否想喝点什么。史密斯没有回答，而是把汤姆手中的隐形药水当成白开水一饮而尽。汤姆当场惊呆，那可是隐形药水啊！
接下来，发生了令人难以置信的一幕。喝下隐形药水的史密斯并没有消失，反而变成了一只鸽子。原来药水吸收了鸽子羽毛中的基因，导致他变成了一只鸽子。隐形药水不再是隐形药水，而成了变形药水。这让史密斯感到非常崩溃，因为他一直以来最讨厌的就是鸽子，现在竟然要自己变成一只，这简直令他无法接受。然而，即便是鸽子，他也是最帅酷的那一只。
汤姆养的宠物鸽子立即凑了上来，希望能和史密斯亲近。然而，史密斯却感到非常失望，准备离开。尽管汤姆极力劝说，指出鸽子会飞行且拥有众多同伴，是最佳的潜伏方式，还提议可以成为史密斯的搭档，两者的刚柔并济必定能够战无不胜。
然而，史密斯一直以来喜欢单干，根本不需要伙伴。他认为现在自己变成这个样子也是汤姆害的。因此，他再一次决定解雇汤姆，走到自己的跑车前，试图挥动翅膀飞上车，但他却无法实现。汤姆见状，紧握武器前来帮忙，史密斯本来不想再见到这个怪胎，然而另一名女特工带着调查组的人竟然也追到了这里。
她们一到场就对汤姆的住所进行轰炸，史密斯别无选择，只能让汤姆上车，并启动了自动驾驶模式。女特工的手下紧追不舍，史密斯希望用武器击爆他们的轮胎，但汤姆一直阻拦他，提醒他不要伤害自己的人，否则将成为真正的逃犯。
史密斯只能拼命驾驶车辆逃离现场，为了洗清嫌疑，他和汤姆搭上了通往威尼斯的飞车。这一路上，史密斯遭遇了许多困难和磨难，他希望汤姆能尽快研制出解药，让他恢复原状。然而，汤姆告诉他解药还需要等待18个小时才能完成。无奈之下，他们决定先前往黑帮大佬所在的酒店，寻找机械男的下落。
但刚到酒店，他们就遇到了黑帮大佬的手下。面对曾经的敌人，史密斯略感警觉，但很快他意识到，自己现在是一只鸽子，根本不必担心这个。于是他大摇大摆地走进大厅，甚至一路上还发出疯狂的鸽子叫声，果然没有人注意到他。尽管他现在变成了鸽子，行动有些不便，但他并不在意。
此时，汤姆试图帮助他，但史密斯却拒绝了，因为他一直喜欢单打独斗。然而，几只鸽子突然亲昵地凑了过来，原来它们被史密斯帅气的外表所吸引。史密斯努力挣脱束缚，随后化身为特工鸽子，巧妙地躲避各种障碍物，爬上酒店前台，并成功夺得了黑帮大佬的房卡。
然而，此时其他鸽子却闹了起来，这引来了前台的女员工。女员工一看到他，立刻用键盘将他拍扁，并把他扔进垃圾桶。尽管作为主角的他没有彻底死去，却从垃圾袋中钻了出来。与此同时，其他鸽子赶来，并将房卡交到他手上。
于是，史密斯拿着房卡，径直赶往黑帮大佬的总统套房。为了不被对方察觉，他以鸽子的形态隐藏起来，躲在沙发后面，用声音逼迫黑帮大佬透露机械男的下落。然而，其他鸽子再次闹了起来，黑帮大佬察觉到了不对劲，立刻将史密斯抓住并虐待。
好不容易挣脱，史密斯打算用一拳将黑帮大佬击晕，然而他忘记了自己只是一只鸽子。眼看着他就要被黑帮大佬砸死，突然黑帮大佬突然软倒在地。原来是汤姆赶来救他。
黑帮大佬不仅皮糙肉厚，而且嘴硬。看他死活不愿透露机械男的下落，汤姆拿出吐真剂喷了一口，黑帮大佬立刻交代了机械男的行踪和计划。他们计划偷取特工局的保密名单，以此来*害所有特工。
然而，这时女特工带领调查组的人也追到了这里。面对这种危险形势，史密斯和汤姆用黑帮大佬挡住门口，趁机逃离。然而敌人实在太多，他们无法逃脱。汤姆拿出自己的圆珠笔，却被一只鸽子一口吞掉。眼看他们即将陷入困境，这时吞下圆珠笔的鸽子，仿佛获得了超能力一般，喷出了比口香糖还要粘稠的物质，将女特工和她的手下全部粘住。
随后，两人准备前往特工基地，阻止机械男偷取特工名单。在路上，汤姆调制的解药终于到了时间。他取下史密斯的羽毛，放入透明液体中，然而奇迹却没有发生，他的实验失败了。史密斯险些崩溃，他再也无法变回原来的样子，这将给大家带来危险。
汤姆太善良了，然而他的善良并不能换来世界的和平。在他看来，对待恶人只有以恶制恶。尽管他也想对付恶人，但他希望尽量减少伤害。他们为此大吵了一架，但很快又和好了。
很快两人抵达了特工基地，然而就在他们到达的同时，基地被炸毁了。一架*人无人机窃取了保密名单，破坏了天花板后逃离了现场。为了阻止它，史密斯和汤姆迅速爬上天台，但无人机已经飞得很远。情急之下，汤姆抓起史密斯打算扔出去，因为他现在是一只鸽子，可以飞行。然而史密斯却不敢展开翅膀飞行。
最终，其他的鸽子飞来救了他。为了阻止无人机，吞下圆珠笔的鸽子喷出了冰冻喷雾，冻住了无人机的爪子，成功夺回了保密名单。然而，无人机却猛烈地射击过来，几只鸽子拼命躲避。尽管它们成功躲避了攻击，但附近的老奶奶的房子却遭到了损坏。更糟糕的是，保密名单再次被无人机抢走了。
幸运的是，汤姆骑着小电炉赶来，夺回了保密名单。然而，就在他欢乐地驾车狂奔的时候，一只铁臂挡住了他们的道路，将他们撞倒在地。史密斯被摔晕了。当他苏醒过来，看到汤姆被机械男按在地上折磨，他想要去救他，但却无法发挥任何力量。
危急时刻，汤姆扔出一小块面包屑，吸引了所有的鸽子飞过来，他才得以脱险。这时，女特工带着调查组赶到了现场，机械男见状变回了史密斯的形象，然后召唤出*人无人机逃走了。
众人都惊讶不已，史密斯怎么会有一只机械手臂？这明显有些不对劲，他们开始怀疑是否有人在陷害史密斯。接着，史密斯和汤姆为了避开调查组的追捕，潜入了海里。汤姆突然激动地抱住史密斯，结果却抱得太紧，结果史密斯竟然下了一个蛋，这让一名顶级特工变成了下蛋的鸽子。史密斯当场傻眼，因为他原本是一只公鸽子，他不明白自己怎么会下蛋。
这时，汤姆恍然大悟，原来史密斯根本不是公鸽子，而是母鸽子。之前他一直把史密斯当成公鸽子在进行解药的配制，所以才没有成功。知道了关键原因后，汤姆赶紧重新调配了药物，在一番折腾之后，药水终于配制完成了。史密斯喝下药水，瞬间恢复了人的形态。然而此时，他却不希望汤姆和自己再继续冒险，于是他将汤姆打晕并送走。
本以为他能阻止机械男的阴谋，但他高估了自己，低估了敌人。机械男并不只有一台*人机器，而是数千台。它们全部朝着特工基地飞去。史密斯也被电击晕了过去，当他苏醒时，发现自己被五花大绑。他询问机械男为什么要陷害自己，机械男也不再伪装，因为他曾经因史密斯而脸部被炸毁，但幸存了下来，所以他要向史密斯展开报复。
尽管了解了真相，但此时的史密斯无法反抗。与此同时，汤姆也苏醒过来，他立即决定去帮助史密斯。机械男看到潜水艇的信号接近，派遣了无人机去阻止。紧接着，巨大的爆炸声从水下传来。史密斯以为汤姆被炸死了，深感痛苦。然而就在这时，几只鸽子飞来，随后汤姆出现了。原来他使用泡泡气囊逃过了一劫。史密斯终于明白，用拳头解决不了问题，于是决定使用汤姆的武器来战斗。
于是，两人成为了合作伙伴。史密斯再次闪亮登场，但这次他没有携带任何致命武器。然而，闪粉猫咪释放的血清素已经能够让机械男高兴一整年了。这时，女特工带领手下赶到现场，他们已经了解了真相。每个人手持汤姆发明的高科技武器。史密斯用炮炮枪阻挡子弹，将它们化为乌有。女特工扔出手榴弹，变成了万花筒，直接晃花了机械男的眼睛。而汤姆躲在角落里，准备解开机械男手中的装置，让无人机停止活动。
在另一边，无人机正在猛烈地撞击特工基地的防御屏障。然而，在这个关键时刻，受到吐真剂的影响，史密斯和女特工不小心泄露了拦截无人机的计划。机械男迅速甩开两人，准备逃走，但汤姆意识到不妙，使用圆珠笔释放出粘稠物质阻止了机械男。然而，结果是他自己也被卷走了。幸运的是，史密斯迅速抓住了汤姆的背包，并顽强地抵抗着被卷走的力量。
尽管史密斯也努力抵抗，但木桩的支撑力不够。汤姆被卷上天空，此时他终于解锁了机械男手中的装置。只要他按下确认键，所有的无人机就会失去功能。然而，按下确认键意味着他们两人会从高空坠落并丧生。最终，汤姆做出了决定，按下了确认键，使所有的无人机失效。他将唯一的救生泡泡给了机械男，让他安全着陆，而他自己开始高速坠落。
危机时刻，史密斯变成鸽子飞来，但他一人的力量无法救下汤姆。然而，更多的鸽子赶来帮助，使汤姆安全回到地面。机械男也被捕获。
两人成功拯救了众人，然而他们却因违抗命令而被解雇。不过很快，他们被一个麻袋抓走，原来是特工局长下令的。她为他们组建了一个新的团队，让他们利用超凡的能力去拯救更多的人。
故事的最后，善良和爱拯救了所有人，而不是以暴制暴，希望世界都能充满爱的力量。Love and peace。
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