在火影忍者OL里除了阵容搭配需要注意外，查克拉的使用也值得玩家关注。因为在搭配好阵容后，也需要了解查克拉的消耗情况。因为查克拉数值是固定的，一旦查克拉严重超出预算，那么实战的伤害也无法全部打出来。
高伤阵容
通常情况下，查克拉消耗越多，对敌人造成的伤害也就越高。因此很多玩家都会选择拥有高伤害奥义技能的忍者，例如我爱罗或千手扉间。这两个忍者查克拉消耗分别为80点和60点，实战方面最低也要等到第二和第三回合才可以使用。这两大忍者奥义范围伤害很高，用来消耗敌人是非常不错的选择。但是需要注意，这两大忍者的奥义就需要四个回合不能使用其它忍者的奥义，严重拖沓对战的节奏以及效果。一旦敌人有打断或控制型奥义，我方会疲于招架，导致伤害无法全部打出。
常规型搭配
常规型阵容搭配是考虑全方位考量了忍者组合搭配以及奥义的使用，例如携带20和40点查克拉消耗的奥义技能。开局起手即可释放奥义，第二回合再次使用40点查克拉消耗的奥义，不论是伤害还是应对突发情况，没有丝毫问题。第三回合可以使用的查克拉是60点，让玩家能充分利用自身奥义，在打出范围伤害的同时，搭配追打，单体伤害也很高。这样使用奥义会更加的灵活，也能让阵容发挥最大实力。
至于游戏的中后期，玩家选择的阵容中奥义消耗的查克拉基本都是40点的。此时查克拉使用方面需要注意，第二回合开始优先使用拥有打断效果的奥义，用来针对敌方的奥义和追打，避免被损耗太多的生命值。第三回合则可以使用两大奥义技能，需要注意，使用时选择一个高伤害和一个可以触发多追打次数的，剩下一个奥义追打留在第四回合。这样的组合使用，可以让每回合的伤害都能最大化，提升忍者小队的综合实力。
小结
在火影忍者OL的对战中，单个忍者的实力固然很重要，但实战毕竟是群体战斗，阵容搭配的合理性非常关键。若玩家不利用好每个奥义的效果以及查克拉的使用，会被敌人分分钟教育。因此在阵容搭配方面，千万不要无脑选择高查克拉消耗的。高查克拉消耗的忍者可以有，但是需要注意查克拉消耗的组合，尽量将战斗的回合降至最低，提高对战效率。
