女人怀胎百年生下一条蛇，男人毫不犹豫地将其吞下，身体瞬间痊愈。然后，它与祸蛇融为一体，拥有了永生之力。祸蛇是天地之初的邪物，以吸取人类的*和执念为生，与天地同寿，真身更是不死不灭。为了阻止祸蛇为祸人间，来自东岛、南疆、西域和北天的四大门派联手封印了祸蛇的真身，并在女皇体内筑下了青龙、白虎、朱雀和玄武四座神像。为了天下苍生，女皇吞下人鱼肉，变成了不死之身，成为封印祸蛇的最佳容器。
然而，即使真身被封印了几百年，祸蛇的精神力仍然可以通过封印投影到人间，化身虚影作乱。四大门派会派出最强的阴阳师前往天都合力斩蛇。贺茂忠是东岛的阴阳师，是上一代斩蛇之人。
安倍晴明是他最得意的弟子，但他虽然天赋异禀，却无法学会最简单的守护咒。十年过去了，晴明仍然无法发出守护咒。师父，守护咒不学了行吗？你不能只会进攻，不懂守护。当师父向他攻击时，晴明急中生智，用移形幻影术将冰锥转移到了另一个空间。然后，他得意地告诉师父，这样也可以保护自己。但师父泼了他一盆冷水。你这只是小聪明，遇到真正强大的力量是不行的。
不久之后，这句话应验了。前方的冰山开始震动，师父预感大事不妙，第一时间用穿行咒将晴明送走，发现冰山里面有一个巨大的身躯正在移动。师父拿出符咒，以鲜血为盟，召唤出三大式神。吾以鲜血缚令诸神。雪天狗、精灵子、狂画师和冰山。眼看冰山出现裂缝，狂画师挥动手中神笔，画出数万道符咒，瞬间便布满整个冰川。雪天狗则以极快的速度飞上冰山，不断加强封印。金灵子则留在身前保护主人，并为他提供更强大的灵力。四人配合默契，不断地向祸蛇发出封印。然而，随着一声怒吼，祸蛇还是破印而出，降临人间。与此同时，其他阴阳师也纷纷赶来，祸蛇准备向众人发起攻击。师父命令众弟子施展守护咒抵挡，但唯独晴明不会。他只能打开传送门，试图转移攻击。正如师父所说，在强大的力量面前，他的小把戏根本无法招架。危急时刻，师父为了保护他，让出了自己的守护咒，自己却被祸蛇喷出的毒刺贯穿身体。这一刻，他才意识到守护咒对阴阳师有多重要。但已经太晚了，师父用尽最后的一丝灵力，幻化出灵珠交给金灵子。金灵子瞬间心领神会，此生无悔侍奉为荣。话音刚落，金灵子手持灵珠，转身冲向祸蛇。师父则祭出符印，打开入口，帮他接近祸蛇。随后，金灵子冲进了祸蛇的体内，强大的灵力瞬间爆发，让祸蛇承受了极大的痛苦。雪天狗趁机施法将洞口冰封，师父也再次念动咒语，众人齐心协力，终于将祸蛇重新封印。然而，这一战让师父耗尽了灵力，命不久矣。临终前，他告诉晴明，祸蛇只是一道虚影，真正的妖身被封印在天都城里。现在，祸蛇虚影已经出现，妖身即将苏醒。
师父命晴明前往天都，与四大门派联手消灭妖蛇。于是，晴明孤身一人前往天都。随后，四大门派代表陆续到达，包括南疆女法师泷夜、云南省伴郎博雅、内廷法师鹤守月和鸿若大师。然而，鸿若大师在第一天就离奇死亡。这让几个人开始相互猜忌。
由于司天监内已经布满了结界，任何妖物都无法进出，因此公主断言凶手就在司天监内。为了查明真相，泷夜法师拿出了专门寻找妖物的蝌蚪，没想到蝌蚪指向了晴明，这让本来就被怀疑的他更加陷入了困境。公主见状，立即下令逮捕晴明。此时，博雅站出来为他辩护，原来他昨晚在晴明房间安装了监听器。然而，一夜过去了，他并没有离开房间。仅仅凭借博雅的一面之词，还不足以洗脱他的嫌疑。
在这个时候，晴明在自己身上发现了一只蛊虫，而蛊虫指向谁，蝌蚪就会指向谁。这表明有人在故意栽赃陷害。就在这时，蝌蚪突然指向公主，让所有人都感到震惊。好在泷夜及时解释道：“我的蝌蚪有时会出现错误。公主，请不要介意。”听了这话，公主也不再追究此事，因为现在最重要的事情是消灭妖蛇。如今，四大法师中少了一人，天皇便命鹤守月代替鸿若法师，并要求四人在三天内唤醒镇守妖蛇的四大神兽。要唤醒神兽，就需要用妖怪的内丹进行滋养。于是，几个人开始了猎妖行动。
鹤守月首先找到了一个纸妖，这个纸妖整天抱着琵琶弹奏，凡是听过他琴声的人都被迷惑了。而阿泷则利用蛊虫找到了几个作乱的小妖。最出色的是博雅，他用二郎神的天眼收复了一个千年花妖。大家把妖灵献祭给相对应的神兽，只有晴明每天花天酒地，享受生活。这让博雅十分不满。
深夜，晴明独自找到贺守月，因为他想知道贺守月是否是*害鸿若法师的凶手，毕竟这里的结界都是他布下的。现在，顶替鸿若法师的人也是他。只见鹤守月用手轻点眉心，额头上出现了一道符文。原来他是师父的式神，而师父已经去世了。作为式神的贺守月也即将消失，晴明也因此打消了心中的疑虑。
接下来的几天里，晴明依然沉迷于温柔乡，博雅则一脸不满。然而，晴明实际上在收集情报，因为他被分配去唤醒最难对付的青龙神兽。普通小妖的灵力无法唤醒他，而我只需以最强烈的情感*为诱饵，便可事半功倍。
此时，丫鬟送来一份情报，晴明看后惊愕不已。两人连忙赶到公主的寝宫，却发现公主已被妖物附身，倒在桌子上。晴明拨开公主的衣服，只见她背上蠕动着数条蛆虫般的虫子，让人不寒而栗。
