以下是《以撒的结合忏悔》的通关流程：
初次通关：击败来自地狱的四位骑士Boss，然后击败Mom boss。
第二次通关：击败来自地狱的四位骑士Boss，然后击败Mom's heart boss。
第三次通关：击败来自地狱的四位骑士Boss，然后击败妈妈的心与怪异双胞胎。
第四次通关：击败来自地狱的四位骑士Boss，然后击败松饼boss。
第五次通关：击败来自地狱的四位骑士Boss，然后击败撒旦boss。
最终通关（真结局）：完成所有十二张卡牌，在地牢、地下室、洞穴和地狱中击败Boss，然后击败Isaac本人和蓝色（悔恨）Baby。
