“孟德尔随机化”1图1表拿下7.9分文章!（孟德尔研究所）

尔云间一个专门做科研的团队

欢迎点赞收藏关注[给你小心心]

话说，最适合临床科研人员的发文途径是什么？

在去年小云肯定会给你最推荐“纯生信”，但现在生信发文很多都要求“干湿结合”了，这样卷起来对没有实验条件的小伙伴可就不怎么友好了···

不过事情总会有转机，好消息是现在又出现了2条高性价比发文途径可以作为常规生信分析的补充，就是“临床公共数据库挖掘”和“孟德尔随机化”~

这两个方向的文章小云前面也推荐过了（ps：感兴趣的小伙伴可以移步文末点击链接观看哦），反响相当不错，说明大家对于这两个方向的兴趣比较高，那小云就得继续更新啦！

先更一篇风头正盛的孟德尔随机化（MR）文章吧！这篇文章分析比较简单，仅用1图1表就搞定了7.9分的文章，发文性价比简直了啊，感兴趣的小伙伴抓紧上车啦，抢占发文红利走起！

文章题目：抑郁症和24种胃肠疾病:一项孟德尔随机化研究

发表杂志：Transl Psychiatry

影响因子：IF=7.989

发表时间：2023年5月

研究背景

抑郁症是一种常见而严重的精神疾病，与普通人群相比，抑郁症患者中消化系统疾病的患病率更高，大多数观察性研究已经调查了胃肠道疾病在抑郁症发展中的作用，但对其反向影响的调查有限。与传统的观察性研究相比，MR可以最大限度地减少反向因果关系。目前抑郁症对大范围胃肠疾病的影响尚未得到研究。

研究方法

1. 数据来源

重性抑郁障碍的遗传数据来自GWAS研究，该研究对来自英国生物库研究、23andMe和精神病学基因组学联盟（PGC）的重度抑郁症工作组的807553个个体（246363个抑郁症病例和561190个主要是欧洲血统的对照组）的数据进行了元分析。24种胃肠道疾病的遗传数据来自英国生物库研究、FinnGen研究和两个大型联盟，包括国际炎症性肠病遗传学联盟（IIBDGC）和衰老遗传流行病学研究（GERA）。中间介质身体质量指数、吸烟和二型糖尿病的遗传工具变量分别从公开的GWASs中提取。详见表S1：

表S1 研究所用数据来源

2. 工具变量的选择

重性抑郁障碍的遗传工具变量选择：总共有98个单核苷酸多态性(SNPs)在全基因组显著性阈值上与抑郁症相关(P < 5 × 10−8)且没有连锁不平衡(定义为r2> 0.01)（表S2）。

表S2 重性抑郁障碍的SNPs特征

3. 研究设计

应用单变量孟德尔随机化（MR）分析检测24种胃肠道疾病与重性抑郁障碍的遗传易感性的关系，进一步进行多变量MR分析，以检测体重指数、吸烟和二型糖尿病病的中介作用（图1）。研究满足MR分析的三个主要假设：

1）工具变量（IVs）与暴露密切相关；

2）IVs不应与潜在的混杂因素相关；

3）IVs应该只通过暴露来影响结果。

图1 研究设计图

4. MR分析方法

MR分析采用在乘法随机效应模型下用反方差加权法（IVW）作为主要分析方法，并引入了多种敏感性和异质性分析方法，所有分析均使用R软件包TwoSampleMR、MendelianRandomization和MRPRESSO进行：

利用三个敏感性分析（weighted median、MR-Egger 和MR-PRESSO）检测潜在的水平多效性和检查相关性的一致性；
Cochrane的Q值用于评估SNPs估计值的异质性；

主要结果

1. 抑郁症的遗传易感性与24种胃肠疾病的相关性

IVW分析显示，抑郁症的遗传易感性与24项研究的胃肠疾病中的12项呈正相关，在多次比较校正后，这些相关性仍然存在。图中显示抑郁症的遗传易感性与肠易激综合征、非酒精性脂肪肝、酒精性肝病、胃食管反流、慢性胰腺炎、十二指肠溃疡、慢性胃炎、胃溃疡、憩室病、胆石症、急性胰腺炎和溃疡性结肠炎的高风险有关（图2）。