《航海王》中，路飞等人被小丑巴基分别关押。在外面，路飞遭受着酷刑。巴基将路飞绑成大字型，放在舞台中央。不过，这种小伎俩对橡胶体质的路飞毫无作用。看到路飞不吃这一套，巴基试图从心理上击垮他，向他诉说香克斯曾背叛过自己。然而，了解香克斯为人的路飞不相信巴基的话，听到他污蔑自己的偶像，路飞愤怒地挣脱锁链，用橡胶手枪攻击巴基。虽然路飞的攻击对拥有四分五裂技能的巴基无效，但他还是向巴基展示了自己的技能。这时，狡猾的巴基用烟雾弹击昏了路飞，将他关进了一个盛满海水的水箱。
即将被淹死的路飞回忆起香克斯为救他断臂的往事。当看到山贼再次出现在玛琪诺的酒吧时，年少无知的路飞愤怒地要上前理论，结果被山贼头领抓住。香克斯一伙及时出现，开始教导山贼做人。这场战斗毫无悬念，山贼很快被清理干净。自知惹到大麻烦的山贼头领挟持着路飞逃到海上。然而，等待他的将是近海之王的攻击。
一阵小浪花翻过，山贼头领成了近海之王的食物。同样落水的路飞被香克斯救上了船。近海之王显然没吃饱，准备继续攻击船上的两人。为了保护路飞，香克斯断掉了一条手臂。近海之王在香克斯的霸气下悻悻离开。这次事件也让路飞心怀愧疚，在香克斯要远行前，路飞也不好意思过去送别。看穿路飞心思的香克斯主动前来跟他告别，并将自己最珍贵的帽子送给了他。路飞也和红发约定，等自己长大成为一个比他们更厉害的海贼，他们就会再次重逢。
这时，巴基的手下卡巴吉进来跟索隆聊天，两人回忆起了曾经的恩怨。作为海贼猎人，索隆曾经为了赚赏金连续追*了卡巴吉和他的哥哥好几个星期。最后，卡巴吉的哥哥死在了索隆的刀下。基于这个渊源，卡巴吉开始用转盘飞刀折磨起索隆，想让他尝尝自己曾经的恐惧。不过，这所谓的折磨只是卡巴吉自己的一厢情愿。索隆自始至终都没有眨一下眼睛，甚至没有发现自己的飞刀已经快要帮他割断了束手的绳子。看着时机成熟，娜美突然使出飞踢，与索隆一起制服了卡巴吉。
脱困的两人迅速商量对策，前往舞台营救路飞。眼看水中的路飞快窒息了，娜美用飞棍击碎了水箱。路飞被水呛到后，吐出了吞下的航海图，趴在地上咳个不停。巴基和路飞被海水冲倒，互相扶持着爬行。一个人关心着帽子，另一个人则关心着航海图。拿到航海图的巴基喜笑颜开。索隆清理了外面的小兵，但面对嚣张的巴基，他的攻击并没有奏效。巴基用碎裂的身体与索隆等人玩起了丢手绢的游戏。
路飞三人的攻击无法对付巴基的四分五裂技能，战斗陷入僵局。最终，路飞想出了一个主意，配合娜美和索隆，将巴基的身体全部关进了箱子。只有路飞的火箭炮才能将巴基打飞，被囚禁的村民也被他一一解救。
离开前，他们得到了村民们的欢送。不过，在船上，索隆带来了一个坏消息：娜美用来藏东西的甲板破了一个洞。于是，路飞三人开始寻找新船的旅程。在下一站，他们遇到了乌索普，并帮助他的青梅竹马可雅解决了一场由黑猫海贼团引发的危机。
