原因如下：
一，孙悟空与菩提祖师的历史原型所决定的。
孙悟空代表的是明朝皇帝明世宗朱厚熜，菩提祖师代表的是杨慎，朱厚熜以藩王入主皇位，杨慎的父亲杨廷和出了大力，杨慎还给朱厚熜说过课，可以说当过朱厚熜的老师。
在朱厚熜上位过程中，杨家全程参与，是重要知情人，里面总归有诸多不为人道的秘密，明世宗当然不想杨慎乱说。
大礼议事件最后杨慎遭廷杖两次，流放云南，此乃明世宗直接警告杨慎之言。只是身份临时互换，遮人耳目罢了。
二，西游主旨决定。
西游记明写唐，实写明。然其主旨之一是写各派势力的博弈争斗。菩提祖师（后期是佛祖如来）倾向的是三教合一，天庭、儒家、道家、佛教等悉数登场，孙悟空的身份不明最有利，作为主要角色，背后有两个大佬顶着，一是太上老君，一是如来。其意深远。
