第一：混元子层次：大家都知道，任何事物都在运动，运动本身它既需要在空间有位置移动，同时还有一个时间。每个人生下来之后，就在空间当中生活着，就占有了一个空间，看可以看得见、摸可以摸得着，因此，空间的客观存在就比较好领会、好理解。而时间就不一样了，时间一过去就跑了，逮不着了。我们脑子里还要有个时间在里面，事物只要一运动，不但有个运动的空间，还有个时间藏在里面，时间从过去到现在像一条线这么走，它当中一刹那这一点和空间的那个点一结合，那个东西叫做混元子。
混元子是时间、空间这两个一混合，混合之后达到非常微细的境界。混元子是非常小的，小到再没办法分了，到没法再分的时候就没差别了，一就是多，多就是一，一个混元子是这样，千万个也是这样，它没区别，因为它可以联系到一起了，所以是一种绝对的状态。没有时间与空间的区别，完全混合到一起了。这种状态的存在是非常短暂的，只有那么一刹那就变成初始混元气了。
第二：初始混元气层次：初始混元气也叫原始混元气，它是由混元子生化出来的。这个气也是非常均匀的，但它已经有了时间与空间的区别，不过从具体事物来说还没有区别。它已经可以变化了，这个层次还只是有了可以变化的意向，但还没有真的变化。而混元子层次它本身是不能变的，它时空都统一了，混元子只能生成初始混元气，它进不到具体事物当中来。而初始混元气在没变万物之前非常均匀，连成一体不可分别，充满整个宇宙，它不但可以生成具体事物，而且在具体事物当中还存在着它。
我们只有了解了原始混元气是怎么来的，才能对混元气有更深刻的了解和认识。混元气是超常状态下才能感觉到的，没有超常智能只能靠理性思维去想，明白道理用这个道理去想，想着想着脑子里会有感觉了，感觉到它以后马上逮住它，经常是一动就有，一动就逮住它，这样功夫就不一样了。有时候我们闭着眼睛想银河系中心的时候，脑子里有一种空空荡荡的感觉，非常短的一刹那，一种“虚、灵、空”的感觉，非常舒服快畅，这就是感觉到原始混元气了，但跟体察到意识活动不等同，不是“见性”。
第三：万物层次的混元气：初始混元气再向前发展就变成我们看到的万物层次的混元气了。这一层次的混元气，可以是无形无象的，也可以凝聚成有形有象的实体物，而在实体性物质周围又有它的气场，在实体物当中，还有无形的气在里边流动。我们常态智能只能看到具体实物，而看不到它周围的混元气。所以，万物层次的混元气比原始混元气、混元子还不好理解。因为混元子、原始混元气都无形无象，我们用意识去琢磨就行了，而万物的混元气不行，你有个笔，这个笔你能看得见，摸得着，习惯了，你再说它里面都有混元气就不习惯了，一琢磨就琢磨到笔上去了。
在万物层次中，物质是不一样的，从气功高度来分，最少可分成两大类型：一种是无生命的物质，一种是有生命的物质。我们知道有生命的物质是需要进行新陈代谢的，必须和外界进行物质交换，和外边的混元气起作用，把外边的混元气拿进来，和自己混化后把废物排出去。生物的混元气，它的整体特性，它的平衡，是在和外界不断进行物质交换过程中来维持的，这就是生物和非生物混元气的根本不同点。有机的物质由原来生成它的东西生成它之后，又和外面发生混化，这样来维持它的正常状态，我们把原来生成它的混元气叫先天气，形成之后再和外面交换进来的气叫后天气。无生命的物质基本上不主动和外界发生作用。
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第四 人的混元气：万物从无机物到有机物，有机物里有植物、动物，动物再到人类。人在动物当中有了意识，有了主动性，有了随意性。动物的主动性只是根据生命活动的需要，而人的活动可以不是根据肉体生命需要的，可以是精神活动的需要。所以到了人就和动物的形气神不一样，人是靠着精神活动来统帅这一切的，有了意识，而且意识活动的混元气和一般的生理相关的生命活动的混元气不一样了，我们叫它意元体。
第五：意元体是脑细胞的混元气。
混元气的层次一共五层，最根本的属于道的层次，是绝对的时空，混元子层次；最根本的物质，初始混元气层次；万物的混元气层次；人的混元气的层次；意元体混元气层次。其实意元体本身也是人的混元气，为了研究得深透细致，把意元体分成一个层次。
更深入的了解了混元气，就能够让混元气更好的为大家所用。比如初始混元气，原来我们练功常常讲把虚空中最原始的混元气聚过来，现在明白了这个初始的混元气是怎么来的了。
