虽然游戏的故事无法深入探究，但不可否认的是，“基因代理人”的战斗系统是值得称赞的。
即便通过游戏内的人物进行建模方法都是一个简单的方块人，但是在战斗的过程中，玩家来说还是我们可以自己看到满地的短肢与鲜血。或者说，也许他们正是它简单的建模，给游戏中血肉横飞的镜头的出现，增加了工作一丝可行性。
游戏里枪械的多样化也为玩家可以提供了良好的游戏活动体验。
除了在物资稀缺的商店购买外，玩家还可以在执行任务时打开盒子来解锁大量强大的武器。
其中包括一支大射程猎枪、一支大射程火焰喷射器、一挺高速机枪、加特林机枪和一支狙击步枪。
充足的物资，大量的敌人，结合游戏前期的各种武器和大量的伤害，这些因素是综合的，让玩家依然可以体验到《基因特工》这款以上帝视角拍摄的射击游戏中无与伦比的割草快感。
除了进行枪械战斗能力以外，《基因特工》里还偶尔穿插着一些相关小游戏。
例如，短小但移动的赛车，和地下更衣室与“哲学家”的战斗。
