在《海贼王》和之国篇章中，正邪双方都出现了一种特殊的人物，就是忍者。光月御田、草帽一伙有雾之雷藏、小忍，而四皇凯多、黑炭大蛇一伙则有御庭番众。
忍者这一群体非常神秘，根据储信哲哉所著的《忍者》一书中记载，忍者奉行着不滥用忍术、舍弃自尊、守口如瓶和绝不泄露身份的四大原则，其中又以绝不泄露身份为根本原则，因此日本正史中对忍者的记载很少，往往需要在一些流传下来的忍术秘本中才能看到更多的事迹。
1、 日本忍者的起源日本忍者的诞生要追溯到飞鸟时代，也就是中国的唐朝时期。在唐朝随着中日文化交流的日益频繁，中国道教的"五行遁术"也流传到日本，日本人对"五行遁术"进行了本土化的改编和发展，就形成了忍术，那些修行了忍术的人就是忍者。
忍者
忍者主要执行暗*、破坏、情报等方面任务，也就相当于现在的间谍或特工。在飞鸟时代忍者被称为"志能便"，到了奈良时代则被称为"斥候"，在战国时代各个地区叫法都不相同，在德川家康建立德川幕府，日本进入江户时代开始正式命名为"忍者"。
忍者
根据甲贺流名门望月一族所著的《忍术秘书应义传》记载，日本的第一次忍者的使用是飞鸟时代的圣德太子让一个叫做"大伴细人"的"志能便"为他收集情报，使得圣德太子得到了"八耳太子"的称号。
日本忍者分散于全国各地，效力于各个大名、藩主麾下，流派众多，但是追根溯源都源自伊贺流和甲贺流两大流派。
2、 臣服于君主的忍者下克上、群雄并起的战国时代是忍者真正大发展的时代，征夷大将军和各地大名、藩主麾下都有着大量的忍者，是各方势力争夺天下的重要人才。
忍者都源于伊贺流和甲贺流，二者本来就有亲缘关系，两个流派之间也经常通婚，因此忍者之间经常会有亲人同室操戈的事情发生。
在战国时期，甲贺流臣服了织田信长，而伊贺流则站错了队选择与织田信长为敌，还击败了织田信长的次子织田信雄，导致"天正伊贺之乱"，伊贺流差点被织田信长所灭，甲贺流则趁机日益发展壮大。
天正伊贺之乱
本能寺之变织田信长身死，伊贺流依附了德川家康，德川家康取得了天下，建立了德川幕府，伊贺流得以中兴。
3、 伊贺服部，甲贺望月伊贺流共有三大豪门，被称为"三上忍"，分别是服部一族、百地一族和藤林一族。提到服部一族人们最先想到的名字就是服部半藏，其实服部半藏并不是一个人名，而是一个称号或者说身份象征，服部一族的族长都叫做服部半藏。
游戏《侍魂》中的服部半藏
服部半藏中最为又名的是二代"服部半藏"服部正成，服部正成是德川麾下十六神将之一，本成为"鬼半藏"。为德川家康取得天下立下了汗马功劳。
在日本历史上有着伊贺服部甲贺望月之说，伊贺服部指的就是伊贺流的服部一族，而甲贺望月则是指甲贺流的望月一族，望月一族最有名望的是望月出云守本名望月吉栋。望月一族还有一个奇女子叫做望月千代女，是武田信玄麾下的忍者，望月千代女担任武田信玄的"甲斐信浓二国巫女头领"职位，专门为武田信玄培养女忍者。
在《海贼王》中黑炭大蛇手下的"御庭番众"中有叫做半藏和千代女的一男一女两名忍者，就是借鉴了历史上的服部半藏和望月千代女。
千代女和半藏
4、 传奇的伊贺流忍者百地一族在历史上最有名望的伊贺流忍者除了服部半藏，还有百地三太夫。百地三太夫是百地一族的族长，百地一族与服部一族同属伊贺"三上忍"。
百地三太夫因为被朝廷封为丹波守，因此也被称为百地丹波守。他带领伊贺流在第一次伊贺大战中击败了织田信长的次子织田信雄。
百地三太夫有两个最有名的弟子，分别是雾隐才藏和石川五右卫门。
雾隠才蔵本名为雾隐鹿右卫门，是浅井家臣雾隐弹正左卫门之子，在浅井家被灭时逃到了伊贺，跟随百地三太夫学习忍术，之后成为幸村家臣，在1614年的"大坂冬之阵"中死于德川军之手。
石川五右卫门是日本有名的义贼，曾经刺*丰臣秀吉未果，在一次前往丰臣秀吉家盗窃时失手被抓，被丰臣秀吉处于釜煮之刑。
在《海贼王》中雷藏被称为"雾之雷藏"，借鉴了历史上的雾隠才蔵。
《海贼王》中的雷藏
《海贼王》也同样借鉴了石川五右卫门的故事，却按在了月光御田的身上。根据《言继卿记》记载，石川五右卫门以及其全家和同党共20人被处以釜煮之刑。釜煮之刑就是将人放入装满水的锅中，然后点燃锅下的柴火，使水温升高慢慢将人煮死，石川五右卫门为了救自己的儿子，用双手将儿子举过头顶。
石川五右卫门将自己的儿子举过头顶
在《海贼王》中光月御田带领赤鞘九侠讨伐四皇凯多和黑炭大蛇，由于黑炭蝉丸利用模仿果实的能力，变成了光月御田儿子桃之助的样子，分散了注意力，而被凯多打败。
光月御田和赤鞘九侠被黑炭大蛇处以釜煮之刑，为了救赤鞘九侠，光月御田自己在锅中，将赤鞘九侠全部举于头顶，在他临死之前将赤鞘九侠抛出人群。
光月御田被执行釜煮之刑
5、 御庭番众德川家康建立了德川幕府，日本进入了江户时代。德川幕府的第八代将军德川吉宗组建了由忍者组成的御庭番众。
御庭番众是情报机关，主要负责警戒、监视和侦查。
在十九世纪德川幕府面对欧美列强宣布江户城"无血开城"，幕府时代终结，御庭番众解散，忍者也就消失于历史的长河之中。
《海贼王》中的御庭番众就是借鉴了江户时代德川幕府建立的御庭番众，直属于将军管辖。
《海贼王》中的御庭番众
忍者由于其独特的工作性质，一般不见于正史，只出现于一些忍者秘书中，更增加了忍者的神秘感。
就像美国的超级英雄一样，忍者已经成为日本的一种独特的文化符号，虽然正史中没有什么记录，却出现于众多的文艺作品当中，小说、能剧、影视剧、动漫、电子游戏等领域都有着众多的忍者元素的作品。
如今忍者的真相早已不得而知，我们也只能从这些文艺作品中来了解忍者的独特魅力。
