超凡蜘蛛侠3：彼得迅速射出蛛丝，单手拉住汽车。他戴上面具，变得更加强大。男孩戴上面具，勇敢地向上爬。当彼得把男孩送回父亲手中时，他意识到英雄的责任是多么伟大。蜘蛛侠。
第二天，彼得来到实验室，打算向博士请教怪物的事情。然而，这次的到访让他意外发现了蜥蜴人的真实身份，他就是自己之前认识的康纳博士。为了让自己的断臂重新生长，博士一直在蜥蜴的基因里研究生长技术。他迫不及待地将新研发的药剂注射进体内，结果一觉醒来，他真的长出了新手臂。然而，他的基因也在逐渐丧失自我意识。彼得揭发了蜥蜴博士的可怕之处，但警长不相信他，反而认为他在胡闹。彼得突然发现城市出现了大量壁虎，它们似乎是从下水道里钻出来的。
彼得潜入下水道，打算拍下蜥蜴博士的证据。突然，无数只壁虎向他扑来，他的身后出现了尾巴。蜥蜴博士向他扑来，用利爪狠狠地在他胸前划了一刀。正当他要摘下蜘蛛侠的面罩时，相机闪了一下，两人掉进了水里。幸运的是，蜘蛛侠行动敏捷，成功逃脱了蜥蜴博士。蜥蜴博士愤怒地拿起彼得的相机，发现了相机背后写着彼得的名字。
蜥蜴博士从下水道爬到学校，打算在这里进行一场屠*。彼得让格温和同学们撤离，自己则选择正面迎战。他被蜥蜴博士重重击倒，接着被一脚踩住手臂。蜘蛛侠趁机挣脱蜥蜴博士，并迅速换上了蜘蛛侠战衣。他跳到博士的背上，用蛛丝遮挡他的视线。几个回合下来，蜘蛛侠已经逐渐处于下风。他一把将蜘蛛侠按在玻璃上。危急关头，格温挺身而出吸引了蜥蜴博士的注意力。蜘蛛侠趁机发起反攻，用无数的蛛丝将蜥蜴博士牢牢困住，然后拉过格温将其扔出窗外。听着远处的警笛声，蜥蜴博士选择暂时撤离。
彼得循着踪迹来到下水道，找到了蜥蜴博士的地下研究所。他发现了对方真正的企图。他要将这种病毒扩散到整个城市，让所有人变成蜥蜴博士。
此时，他正在前往公司大楼寻找发射器，准备在大楼顶端释放病毒。然而，格温正在公司里研发病毒的解药，现在对于她来说只能是自求多福。蜘蛛侠被警方开枪击中，从空中摔了下来。武装小队将他包围。当他的面罩被扯掉时，彼得突然清醒过来，对周围的士兵发起进攻。
随着彼得缓缓回头，警长发现蜘蛛侠就是他的女儿的男友。他向警长坦白了一切，表示必须阻止蜥蜴博士。然而，当蜘蛛侠准备离开时，一名不知情的警员不小心击中了他的大腿。蜘蛛侠顾不上疼痛，只能用蛛丝止血。他必须尽快赶到对面大楼，阻止博士释放病毒，拯救格温。然而，距离太远，蛛丝无法到达周围的建筑。加上他受伤的腿，蜘蛛侠无法快速到达。
看到新闻的市民知道蜘蛛侠遇到了麻烦，纷纷伸出援手。当初被蜘蛛侠救下的男孩的父亲，为了感谢蜘蛛侠，专门利用自己的施工塔吊，为蜘蛛侠开辟了一条捷径。有了塔吊的高度，蜘蛛侠可以荡着蛛丝，飞快地赶到对面大楼。蜥蜴博士已经到达塔顶，他将病毒装进发射器，距离释放病毒只剩下两分钟。蜘蛛侠赶紧赶来，一脚将蜥蜴博士踹下塔顶，两人展开了激烈的肉搏。蜥蜴博士抓住了受伤的蜘蛛侠，并破坏了他的蛛网发射器，然后摘下面罩，用最伤人的话嘲笑他。可怜的彼得帕克，没有父亲，没有叔叔，孤单一人。他不是一个人。
