在中国四川蜀山一带，山峦迂回起伏，云海飞卷奔腾，令人幻想起天地间的灵气汇集于山岳之间。所以，关于这里的怪诞故事很多，其中相传山中有不死奇人，能吸取天地灵气，突破凡人之躯。御剑飞行，追风逐月，星海飞驰。他们在这里修炼仙术，目的是参透天地间永恒的奥秘。
蜀山群山之中的昆仑山，掌门孤月大师与徒弟玄天宗相恋，事先预感邪恶幽灵血魔会进攻昆仑，自知无力抵抗的她，为保玄天宗姓名借故将其赶下山，并将昆仑秘臧武器“日月金轮”交于天宗，而自己则被血魔所*，昆仑灵气被血魔吸收。
二百年后，血魔再次入侵，峨眉开山祖师峨眉真人，唯恐此战伤及凡人，派大弟子丹辰子止息正要交战的凡人军队。
在途中，丹辰子与玄天宗相遇，共同止息战争迎战血魔，但他们并不是血魔的对手。此时峨眉真人率弟子前来救援斩*血魔。
血魔遁走，利用峨眉山的力量打开血穴，逃入其中。峨眉真人发现血魔诡计，想利用血穴吸收蜀山灵气，真正的战争才刚刚开始。
玄天宗，发现峨眉弟子李英奇，样子酷似师父孤月大师，而他们也互相产生了微妙的感应。
峨眉真安排大弟子丹辰子镇守血穴洞口，玄天宗通知其它门派前来蜀山，众弟子回蜀山备战。
峨眉真人回到峨眉后，其它门派也已到来，发现峨眉山的灵花已经开始枯萎，说明血魔已经开始通过血穴吸收蜀山灵气。蜀山灵气一旦枯竭，蜀山也就不复存在了。
现在唯一能够跟血魔抗衡的就是合并后的天雷双剑，但是至今还未完成合璧。因为必须在灵花彻底枯萎之前完成天雷合璧，李英奇和无忌再次合璧，但是这次并没有成功，无忌引火自焚形神俱灭，李英奇却被月金轮吸收了热量活了下来。
孤月大师交月金轮给玄天宗之时说过，回来如果找不到她，月金轮可以告诉他，她在哪。原来当年峨眉真人，收集孤月大师神识，并重塑了肉身，这个人正是李英奇。
峨眉真收集无忌的神识，并重塑了他的肉身，但是神识恢复却需要时间。无奈之下，峨眉真人只好飞升到另一个空间寻找可以抗衡血魔的武器。
临走之前，峨眉真人传位于玄天宗，因为此时丹辰子正在镇守血穴，也只有玄天宗可以掌控峨眉派。峨眉真人告诉玄天宗，要救蜀山，只有三元合一。三元合一就是三种力量集合在一起，这三种力量就是“精神力量”、“宇宙力量”、“重生力量”。峨眉真人走之后，留下的南明离火，就是精神的力量，在另一个空间找到的武器就是宇宙的力量，至于重生的力量就在他身上只有他自己去感悟。
血穴这边丹辰子在镇守着，并无其它异样，只是出现了一只小蝶妖，丹辰子动了恻隐之心并没有*她，就在丹辰子完全放下戒心之时，她却突然钻进了他的头里，并控制了丹辰子。
峨眉这边无忌肉身已成，道号廉刑，由英奇做他的师父。此时的廉刑神识不清，语言也不通。
为了尽快完成天雷双剑合璧，玄天宗想通过三元宫，洗掉雷剑的记忆，而获得它，但此操作风险也极大，很容易引火烧身元神俱灭。
玄天宗进去了，但没有成功，因雷剑反噬而引火烧身，英奇想用月金轮救他，但是却没有成功。
英奇将玄天宗埋葬在了山下。
此时，蝶妖操控丹辰子带着妖众来到峨眉山，由于妖众势力太强，很快就把峨眉山众弟子打败。此时英奇也赶来，用天剑斩*了很多妖众，但还是被花妖夺去了元神，并把肉身带到了血穴。
南明离火在打斗中掉到了山下，恰巧被神识觉醒的廉刑用雷剑打到了玄天宗尸体旁边，南明离火却意外救活了玄天宗。
而此时，峨嵋道人也有了消息，并把武器传到了这个空间，玄天宗很快拿到了武器。难道武器之后，玄天宗和廉刑决定先救出英奇。
他们把肉身安顿好之后，前去了血穴，经过一番苦战之后，救下了英奇。玄天宗让廉刑带英奇先去找肉身，他*了蝶妖和被控制的丹辰子后与他们会合。
此时的血魔已经找到了玄天宗和廉刑的肉身，正在要吞噬他们肉身之时，廉刑和英奇及时赶到，并完成天雷双剑合并，驱散血魔的血云，并露出真身。
就在玄天宗肉身被血魔吞噬的一霎那，他也赶了回来，并成功抢得肉身，为了彻底消灭血魔，英奇钻入血魔身体内，玄天宗用三元合一的力量彻底消灭了血魔，但同时英奇也已形神陨落，此时的英奇已经有孤月的感觉。
一场神魔大战落下帷幕，玄宗重建了峨眉，并用天剑上英奇的元神恢复了她的肉身，他把峨眉交给了廉刑，然后离开去了昆仑。因为他曾答应过他师父要重建昆仑。
