可以追溯到1909年，由丹麦遗传学家约翰逊正式提出，在此之前被称为遗传因子。
1854年到1863年，孟德尔利用22种不同的豌豆品种进行杂交实验，发现豌豆不同的性状是由不同遗传物质控制的，这些遗传物质来自父母双方，而且来自父母双方的遗传物质在产生生殖细胞时会发生分离。现在我们知道，这些遗传物质就是基因。
基因起源的主要理论是进化论。
根据这一理论，生命形式在数亿年的时间里通过自然选择逐渐演化而来。起初，化学分子在原始地球环境中相互反应，最终形成了复杂的有机分子，如氨基酸和核苷酸。这些分子在复杂环境中发生了进一步的合成和组合，逐渐形成了第一个单细胞生命体。随着时间的推移，这些生命体逐渐进化成了更复杂的生物，其中包括了基因，作为遗传信息的载体。
因此，基因的起源可以追溯到原始地球环境中的化学反应和进化过程。
