秦皇兵马俑是中国考古史上最为重要的成就之一，在20世纪全球考古史上占有着重要的地位。自发掘之日起就广受世界瞩目，被赞誉为“世界第八奇迹”。
众所周知，秦皇兵马俑不但数量众多，而且每一个兵马俑的样貌动作都各不相同，栩栩如生。而有考古学家认为，秦始皇兵马俑的每一个动作姿势都有着自己的意义，其中或许暗藏了许多不为人知的玄机和秘密。目前在考古界与史学界，对秦皇兵马俑主要有以下九个谜题待解。
一、主题之谜
一种观点认为，宣扬军威显示秦政权的巩固和强大无比，当是这组群像的主题；另一种观点认为，秦俑所表现的是秦王朝末年的一幅“昏惨惨、黄泉路近”的一种主题思想：又一种观点认为秦俑的主题思想是统一国家的建立，“大统一”的反映。
二、绿脸之谜
在出土的上万件秦皇兵马俑中，有一件跪射兵马俑非常显眼，此兵马俑上半身的肤色是绿色的，脸部特别明显，这与其他人俑的黄色面庞相比，简直太让人意外了。有专家认为可能是在制作的过程中，颜料配制出了问题；还有专家认为这是当时作战的一种习惯，把脸色涂绿用以恫吓敌人。但这毕竟都只是猜测，尚未得到证实。
三、面东之谜
秦俑坑位于始皇陵东侧1.5公里处。有人认为，面向东方。表示秦坐西向东，并吞六国。也有人认为，秦俑军阵东向，是因为秦始皇本人是灭六国统一天下之人的缘故，近卫军要防御被灭六国人民灵魂的叛乱。也有人认为是秦始皇帝陵正在东。
四、将军之谜
三号俑坑被认为是军幕，但俑坑内并没发现装束、姿态特异的将军俑。一种解释为三号俑坑西侧约150米处，发现一大型“甲”字形古墓葬，墓主人即为秦兵俑坑的将军；另一种解释，项羽在毁秦俑坑时，把军幕和将当成首脑机关破坏的，将被看作战利品拿走了。
五、被焚之谜
秦俑坑发掘后发现一号俑坑儿乎全被火焚，二号俑坑也有一部分火烧。有人认为俑坑焚毁可能是公元206年，项羽入关后把它焚毁的；也有人提出是俑坑内沼气引起的自燃。
六、一号坑之谜
一号兵马俑坑是按实战的军阵编列的。有人认为它是战车、步兵相间排列的长方形军阵；又有人认为它排列的是鱼鳞之阵；也有人认为它是战国末年各军阵场面的提炼、集中。
七、二号坑之谜
二号兵马俑坑是由4个不同兵种构成的一个曲尺形队形。有人认为它是攻击形式或即历史上的雁行之阵；还有人认为它是方阵；又有人认为是古代的疏阵。
八、三号坑之谜
三号兵马俑坑发掘后，大多认为它是统帅一、二号俑坑军阵的指挥部，即古之军幕。近来有人则认为它应是军祭的社宗。
九、四号坑之谜
在二号坑和三号坑之间发现一个未建成的废弃坑。关于这个土坑，有人认为它应是原拟议中象征中军的兵马俑坑；有人则认为它应是计划要修的后勤部队。
