快递超市是中通旗下的代收点，菜鸟驿站是阿里旗下的。主营业务都是代收快递包裹的。但加盟方式可能存在一些区别。
快递超市是中通旗下的，加盟时会对你门店的寄件有一定的门槛要求。一般包裹来源主要还是中通的包裹，其他快递公司是不愿意放的。放在门店的话，会丢失了这一区域的寄件业务，因而店铺的包裹量不是很大。但好处是不需要对接中通的快递包裹。
菜鸟驿站加盟的话是在官网上去申请的，一般审核的时间是比较长的，对门店的位置、装修风格、包裹量是有要求的，是不提供快递对接的服务。只能自己去一家家的对接。
主要区别是性质不同，产生背景不同，功能与价值不同，具体如下菜鸟驿站是一个由菜鸟网络牵头建立，面向社区和校园的物流服务平台，网络平台快递超市是一款专业为小区物业代收点，小区便利店，街道超市专业代收网点，校园代收点快递公司网点连锁店，快递代收点，等快递包裹管理软件
