果皮颜色不同：看到一个事物首先最先观察的是其外表，所以最直观的区别就是表皮颜色的不同。普通木瓜的果皮颜色是青色，而且在快要成熟时才会落地且外表才会有轻微的黄色。而红心木瓜的果皮颜色是黄色，是木瓜中的一个优良品种。在未成熟时果皮是青色的，但成熟以后就会变成橙黄色。
2.果肉颜色不同：当木瓜成熟以后，打开木瓜，我们会发现普通木瓜果肉的颜色是微黄色，而红心木瓜在成熟以后的果肉则为橙红色。
3.品尝口感不同：普通木瓜吃起来会带有一种苦味，但很淡而且有些涩，和红心木瓜的口感上差得很远。红心木瓜吃起来则是香甜可口的味道且软嫩多汁。
4.用途不同：普通木瓜一般被当做蔬菜来食用，被用在菜谱上面居多，只有成熟了之后才会被当做水果来食用。红心木瓜作为木瓜中的优良品种经常被人们当做饭后可口的水果来食用。
5.保存时间不同：普通木瓜的存期比较长，因此不易腐烂，可以长期放在家中。而红心木瓜的的存期很短，特别是成熟之后，如果不马上放在冰箱中就会加快腐烂的速度，放在家中的时间不宜长。
区别不大。水果木瓜，是因为一般把它当做水果食用，红心木瓜就是水果木瓜的优质代表。
